Protein–RNA interactions for Protein: Q96RQ1

ERGIC2, Endoplasmic reticulum-Golgi intermediate compartment protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERGIC2Q96RQ1 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 SNORA38-201ENST00000363946 132 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNA5SP240-201ENST00000365355 128 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.378-201ENST00000365652 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL122017.1-201ENST00000435858 784 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL136234.1-201ENST00000437080 349 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 LINC01691-201ENST00000450546 426 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC022272.1-201ENST00000503478 777 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1038P-201ENST00000516516 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC004492.1-201ENST00000607036 742 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 C8orf59-209ENST00000612977 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.783-201ENST00000613546 102 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL161788.1-201ENST00000441805 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AP005902.1-201ENST00000521358 186 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC084879.2-201ENST00000551656 369 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC245884.12-201ENST00000615364 59 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.9-201ENST00000362354 101 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 Y_RNA.402-201ENST00000383972 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU6-1215P-201ENST00000384441 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ERGIC2Q96RQ1 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 109 ms