Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q15

SMG1, Serine/threonine-protein kinase SMG1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 3,661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMG1Q96Q15 AL031176.1-201ENST00000604554 466 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL009028.1-201ENST00000604895 802 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC009237.15-201ENST00000610252 501 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TUG1_2.1-201ENST00000614234 87 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TRAJ47-201ENST00000390490 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.616-201ENST00000410835 95 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL049714.1-201ENST00000466686 347 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL365434.2-201ENST00000607979 234 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RPL22P22-201ENST00000395439 379 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 DSTNP4-201ENST00000399472 474 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR892B-201ENST00000401279 77 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 HNRNPDLP3-201ENST00000456745 380 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 HMGN2P26-201ENST00000463169 339 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC022960.3-201ENST00000619794 441 ntBASIC-0.49□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORD115-24-201ENST00000363528 82 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC00434-201ENST00000423739 419 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 PNPLA4P1-201ENST00000458328 305 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC130462.1-201ENST00000548144 549 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL512310.8-201ENST00000550183 120 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC069304.3-201ENST00000603938 1084 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORD114-11-201ENST00000363738 75 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORA25.7-201ENST00000364375 127 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL160275.3-201ENST00000423876 471 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AP003716.2-201ENST00000528260 108 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL162726.3-218ENST00000636401 95 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL590730.1-201ENST00000426283 398 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 KATNBL1P6-201ENST00000453433 915 ntBASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL160287.1-201ENST00000455612 432 ntTSL 3 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC02329-201ENST00000554753 511 ntTSL 5 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC012170.3-201ENST00000560159 297 ntTSL 2 BASIC-0.5□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORD83B-201ENST00000386745 93 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC00387-201ENST00000422609 458 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 TOPORSLP1-202ENST00000469756 969 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR7515HG-213ENST00000585872 758 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC013468.1-201ENST00000608680 598 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC013401.1-202ENST00000422017 626 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 USP9YP29-201ENST00000445112 563 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 ZNF736P6Y-201ENST00000447526 1213 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 ANKRD36BP2-206ENST00000575193 1245 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR4441-201ENST00000582623 100 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL592161.1-201ENST00000456389 861 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL355802.4-201ENST00000607635 548 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC139769.3-201ENST00000618383 175 ntBASIC-0.51□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 NDUFA5P10-201ENST00000432147 357 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL353743.2-204ENST00000456242 419 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 LINC01335-201ENST00000507890 389 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 CHST9-202ENST00000581714 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-1099P-201ENST00000363533 107 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU6-116P-201ENST00000384042 109 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC092809.3-201ENST00000415453 231 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 GNGT1-203ENST00000429473 538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MIR4435-2HG-206ENST00000432818 572 ntTSL 5 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC002381.1-201ENST00000447049 280 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU7-165P-201ENST00000458864 60 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 Y_RNA.475-201ENST00000384345 101 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNU2-59P-201ENST00000410482 191 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 USP9YP21-201ENST00000420603 432 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 BRK1P2-201ENST00000442875 223 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTCYBP3-201ENST00000445588 1137 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 NFU1P2-201ENST00000448700 469 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 HMGB1P28-201ENST00000507778 552 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
SMG1Q96Q15 RNA5SP268-201ENST00000516828 124 ntBASIC-0.52□□□□□ -2.49
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