Protein–RNA interactions for Protein: Q96A33

CCDC47, Coiled-coil domain-containing protein 47, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC47Q96A33 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC003659.1-201ENST00000424251 465 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 LINC01594-201ENST00000445083 611 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 RNU6ATAC12P-201ENST00000516542 115 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 AP005435.4-201ENST00000529514 284 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MTATP6P24-201ENST00000576835 677 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 MIR4760-201ENST00000585040 80 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 Z99289.3-201ENST00000605586 594 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
CCDC47Q96A33 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
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CCDC47Q96A33 FGF7P2-201ENST00000332473 296 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 RNY3P10-201ENST00000384764 102 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORA26.8-201ENST00000391306 124 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 BX295541.1-201ENST00000417774 250 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL360091.3-201ENST00000442146 387 ntTSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL360221.1-201ENST00000445989 335 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 AC097467.3-213ENST00000508191 726 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.95□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 LINC02077-201ENST00000465795 409 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
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CCDC47Q96A33 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC091996.1-201ENST00000522274 600 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SCOC-AS1-203ENST00000609616 405 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 SNORA40.18-201ENST00000391200 128 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
CCDC47Q96A33 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
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