Protein–RNA interactions for Protein: Q16740

CLPP, ATP-dependent Clp protease proteolytic subunit, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 277 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLPPQ16740 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC097375.2-201ENST00000510416 579 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 SNORA48.11-201ENST00000517015 89 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC023050.3-201ENST00000541142 333 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 HIF1AP1-201ENST00000553642 175 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 NDUFA8P1-201ENST00000605525 367 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 ZNFX1-AS1_2.1-201ENST00000610973 93 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
CLPPQ16740 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP001783.1-202ENST00000534620 408 ntTSL 2 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC138625.1-201ENST00000567556 483 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL109918.3-201ENST00000603072 338 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Z99129.1-201ENST00000612510 255 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 TDRD15-202ENST00000622654 5805 ntAPPRIS P1 BASIC2.08□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU2-66P-201ENST00000410650 161 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MIR3935-201ENST00000583472 104 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MTND5P26-201ENST00000426018 1752 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-482P-201ENST00000391068 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL035415.1-201ENST00000447150 289 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RNU6-586P-201ENST00000517265 104 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP003469.3-201ENST00000518090 473 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 ASPM-202ENST00000367408 3747 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AL589987.2-201ENST00000417426 582 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC116666.1-201ENST00000453915 551 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.05□□□□□ -2.08
CLPPQ16740 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
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