Protein–RNA interactions for Protein: Q16676

FOXD1, Forkhead box protein D1, humanhuman

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Length 465 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1Q16676 ENPP2-208ENST00000522826 2667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MBNL1-204ENST00000324210 5465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ELAVL2-202ENST00000380110 3691 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC063976.2-201ENST00000425667 3556 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ZNF253-203ENST00000589717 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SNORA70.9-201ENST00000384370 135 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SNORA67-201ENST00000384423 137 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MIR181B2-201ENST00000385004 89 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC022655.2-201ENST00000577280 318 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SCRG1-201ENST00000296506 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ZNF782-208ENST00000535338 3296 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.88□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 DDX3Y-201ENST00000336079 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MYBPC1-207ENST00000545503 3569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 PLCB1-211ENST00000617005 6458 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 PDE5A-203ENST00000394439 6770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ZNF334-203ENST00000593880 2635 ntTSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 Y_RNA.236-201ENST00000364427 111 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU6ATAC24P-201ENST00000516811 135 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MIR1254-2-201ENST00000579553 63 ntBASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC011473.2-201ENST00000596286 240 ntTSL 3 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AHCTF1-201ENST00000326225 8633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 CYLD-203ENST00000427738 8503 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 PTPRD-206ENST00000397617 8248 ntTSL 5 BASIC7.87□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ANK2-226ENST00000612754 6134 ntTSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AP3B1-204ENST00000519295 3986 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 OR2J3-202ENST00000641151 3297 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 TRBV2-201ENST00000455382 421 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 snoU13.4-201ENST00000458916 104 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU7-96P-201ENST00000459535 64 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC073073.1-201ENST00000493920 463 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RN7SL558P-201ENST00000497468 299 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU6-998P-201ENST00000515894 101 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC091163.1-201ENST00000524012 605 ntTSL 4 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU1-30P-201ENST00000606575 163 ntBASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 TMEM30A-202ENST00000370050 3775 ntTSL 1 (best) BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 OR51G2-202ENST00000641926 3326 ntAPPRIS P1 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 TRRAP-204ENST00000446306 12492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.86□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 TMEM8B-202ENST00000377991 14112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 GPATCH2-202ENST00000366935 5851 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SLCO1C1-209ENST00000545604 2557 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ZNF532-201ENST00000336078 6696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ESRRG-219ENST00000487276 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 DTNA-207ENST00000444659 6343 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 VPS35-201ENST00000299138 6790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SNRPGP14-201ENST00000435400 219 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 snoU13.29-201ENST00000459370 104 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SNORD125-201ENST00000459538 96 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC083982.1-201ENST00000485679 344 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 MIR4796-201ENST00000580742 81 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC020891.4-201ENST00000605745 93 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC103706.3-201ENST00000636297 85 ntBASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 LDAH-211ENST00000541941 3807 ntTSL 2 BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 GTPBP10-201ENST00000222511 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.85□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 GAPT-202ENST00000396776 3016 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SLC4A10-202ENST00000375514 5710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 GHR-210ENST00000615111 4814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SDAD1P1-202ENST00000524156 2051 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 POLR1A-201ENST00000263857 12749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU1-146P-201ENST00000364015 165 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SNORA27-201ENST00000384323 126 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 RNU6-808P-201ENST00000391233 108 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC091912.1-201ENST00000511351 248 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SCARNA20.4-201ENST00000516969 131 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AP002518.1-201ENST00000534904 3837 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC024220.1-201ENST00000603675 484 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 CACNB4-229ENST00000636617 5757 ntTSL 5 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SLC12A6-204ENST00000397707 4194 ntTSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 CPNE4-214ENST00000617767 3556 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ANKRD17-203ENST00000509867 8105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 NOS1-201ENST00000317775 12158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC7.84□□□□□ -1.15
FOXD1Q16676 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 LRRK2-201ENST00000298910 9158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MMP13-201ENST00000260302 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RAB30-216ENST00000612684 9783 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SLC38A9-223ENST00000515629 2673 ntTSL 2 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 ZNF525-201ENST00000467003 6107 ntTSL 4 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SAMD3-214ENST00000532763 3690 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 MIR192-201ENST00000384915 110 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC110620.1-201ENST00000416042 228 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC073218.1-201ENST00000458413 171 ntTSL 5 BASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 snoU13.24-201ENST00000458998 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 SNORD4B-201ENST00000459083 72 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AC097484.1-201ENST00000471148 389 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 RNU6-1291P-201ENST00000516591 104 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
FOXD1Q16676 AL358944.1-201ENST00000528537 144 ntBASIC7.83□□□□□ -1.16
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