Protein–RNA interactions for Protein: Q16619

CTF1, Cardiotrophin-1, humanhuman

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Length 201 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTF1Q16619 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ROCK2-203ENST00000401753 4017 ntTSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.49□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 TRIQK-211ENST00000520430 1829 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 Y_RNA.187-201ENST00000363918 113 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 SNORD42.2-201ENST00000365570 69 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA5A-201ENST00000384111 134 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL19P1-201ENST00000411635 428 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC008267.5-201ENST00000424928 265 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC007677.1-201ENST00000445757 515 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC027575.1-201ENST00000481064 460 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 LINC01997-201ENST00000494900 429 ntTSL 2 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC110794.1-201ENST00000505816 425 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 EBAG9-207ENST00000531677 777 ntTSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC006504.2-201ENST00000589471 458 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AC138969.1-213ENST00000331436 462 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AC093151.3-203ENST00000422305 514 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
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CTF1Q16619 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 AC093010.3-201ENST00000570269 15214 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
CTF1Q16619 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CTF1Q16619 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
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