Protein–RNA interactions for Protein: Q16570

ACKR1, Atypical chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 336 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR1Q16570 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 POLHP1-201ENST00000411806 470 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC007879.3-202ENST00000448786 823 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 SNORA14.1-201ENST00000516113 141 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 TRAV1-1-201ENST00000542354 392 ntAPPRIS P1 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL512360.1-201ENST00000555346 234 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC245505.1-201ENST00000556398 224 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 Y_RNA.372-201ENST00000365599 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 DPH3P2-201ENST00000422618 250 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL139415.2-201ENST00000431968 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU7-138P-201ENST00000459479 64 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU5F-2P-201ENST00000516066 82 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR3126-201ENST00000577443 74 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR4524B-201ENST00000581569 115 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL158827.2-201ENST00000602494 330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC015540.1-201ENST00000615828 501 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL691447.3-201ENST00000635020 330 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 LINC01707-201ENST00000425517 627 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC068205.1-204ENST00000532989 481 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 HMGB1P33-201ENST00000563485 527 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC019183.1-201ENST00000580524 505 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC025165.5-201ENST00000602802 578 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL137847.3-201ENST00000611521 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC099654.12-201ENST00000639868 649 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 CEP57L1-201ENST00000359793 2515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-623P-201ENST00000363143 105 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-1068P-201ENST00000410958 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 MTND3P16-201ENST00000452205 344 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RPL21P99-201ENST00000480369 423 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 AC034226.1-201ENST00000506429 487 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ACKR1Q16570 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.8 ms