Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC092106.3-201ENST00000611308 722 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MIR8074-201ENST00000615081 81 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC092656.1-203ENST00000624134 423 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.18-201ENST00000362461 102 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC114485.1-201ENST00000447916 657 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC010409.1-201ENST00000487382 476 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC084756.1-201ENST00000558237 606 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC006386.1-201ENST00000619436 415 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL445984.1-201ENST00000637834 659 ntBASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.01□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 NPAT-201ENST00000278612 6117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-83P-201ENST00000384568 112 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC106883.1-201ENST00000418805 562 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ANKRD10-IT1-201ENST00000426991 800 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 EXOSC3P1-201ENST00000448649 500 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL590365.1-201ENST00000450788 243 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC079349.1-201ENST00000509096 589 ntTSL 2 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL157392.4-201ENST00000609756 345 ntBASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPS27AP14-201ENST00000422868 454 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL139824.2-201ENST00000458731 1095 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC091944.1-201ENST00000521984 449 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SCN9AQ15858 AL031775.1-201ENST00000607014 887 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SCN9AQ15858 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LRRD1-203ENST00000430130 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.99□□□□□ -2.25
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SCN9AQ15858 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-769P-201ENST00000384407 104 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MTATP6P14-201ENST00000455189 673 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RPS23P4-201ENST00000487908 423 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
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SCN9AQ15858 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC02294-201ENST00000549330 497 ntTSL 2 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 MTND4P33-201ENST00000556706 766 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 ATG5-207ENST00000613993 733 ntTSL 1 (best) BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC0.99□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
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SCN9AQ15858 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC241644.2-201ENST00000426504 480 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC0.98□□□□□ -2.25
SCN9AQ15858 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC0.98□□□□□ -2.25
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