Protein–RNA interactions for Protein: Q15853

USF2, Upstream stimulatory factor 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USF2Q15853 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-1053P-201ENST00000515930 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC020891.3-201ENST00000560011 363 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC023043.2-201ENST00000589678 1026 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR8065-201ENST00000620577 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 Metazoa_SRP.32-201ENST00000622685 286 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU4-62P-201ENST00000410125 130 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC114491.1-201ENST00000416095 246 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ZNF736P1Y-201ENST00000440402 1276 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC092473.1-201ENST00000441098 221 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL360271.2-201ENST00000447710 161 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL163195.1-201ENST00000496941 348 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC022616.6-201ENST00000520479 119 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC090023.1-201ENST00000545750 443 ntTSL 3 BASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 DNAJC19P9-201ENST00000555084 351 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC015688.6-201ENST00000577737 104 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR4303-201ENST00000581299 66 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 GNAS-AS1_4.1-201ENST00000616546 112 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC099654.5-201ENST00000636479 350 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 PPP1R3A-201ENST00000284601 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 TLR6-205ENST00000610323 1443 ntTSL 5 BASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC1.05□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SNORD56.2-201ENST00000363242 71 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-203P-201ENST00000384038 104 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR1285-1-201ENST00000408593 84 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-757P-201ENST00000410334 100 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RPL21P90-201ENST00000415692 466 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 LINC01611-201ENST00000428896 477 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 DYNLT3P2-201ENST00000442517 295 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC092892.1-201ENST00000496067 327 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR3118-1-201ENST00000581787 76 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL139286.2-201ENST00000606838 396 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AL139022.2-201ENST00000606934 443 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AP000484.1-201ENST00000620067 1252 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 CAPZA2-214ENST00000628758 525 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC103706.2-201ENST00000638080 240 ntBASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 LINC00643-201ENST00000334389 3247 ntTSL 2 BASIC1.04□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 PPIL4-202ENST00000340881 1089 ntTSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ZNF468-202ENST00000396409 384 ntTSL 5 BASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 PGBD4P5-201ENST00000445958 426 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTND1P12-201ENST00000455231 147 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC068338.1-201ENST00000565567 176 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 Hammerhead_HH9.1-201ENST00000616606 77 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.03□□□□□ -2.24
USF2Q15853 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.03□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU4-68P-201ENST00000364314 141 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA22-201ENST00000383907 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU6-809P-201ENST00000384461 107 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNORA22C-201ENST00000384614 134 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RPL22P18-201ENST00000417197 377 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 SNX2P2-201ENST00000424553 323 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
USF2Q15853 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC1.02□□□□□ -2.25
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