Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

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Length 81 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MT-ATP6-201ENST00000361899 681 ntAPPRIS P1 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-621P-201ENST00000364752 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR1284-201ENST00000408337 120 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO1P21-201ENST00000416634 589 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL591806.2-201ENST00000433122 173 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC108059.3-201ENST00000456388 214 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 HESX1-202ENST00000473921 757 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MEF2C-AS1-212ENST00000514158 713 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU4-54P-201ENST00000516428 129 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-334P-201ENST00000517072 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC090142.3-201ENST00000519012 385 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC133485.1-201ENST00000567176 124 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC138907.6-201ENST00000568401 126 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC110609.1-201ENST00000608228 303 ntTSL 3 BASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.38□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 Y_RNA.124-201ENST00000363339 93 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 Y_RNA.327-201ENST00000365201 102 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORA4.2-201ENST00000365313 147 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORA40.2-201ENST00000390847 128 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SNORD12-201ENST00000391002 90 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-1054P-201ENST00000411293 104 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC063976.4-201ENST00000421971 163 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC005062.1-206ENST00000424516 710 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 ART2BP-201ENST00000453501 499 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL583803.1-201ENST00000454262 334 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC093899.1-201ENST00000457984 376 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC027338.1-201ENST00000514840 825 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RN7SKP219-201ENST00000516825 296 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL590705.4-201ENST00000532209 134 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL121579.1-201ENST00000555129 305 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC01899-203ENST00000584810 337 ntTSL 2 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 BNIP3P8-201ENST00000597863 560 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL353778.1-201ENST00000603149 408 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC006927.2-201ENST00000639256 389 ntBASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.37□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-910P-201ENST00000390844 107 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO3P41-201ENST00000414801 328 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC095059.1-201ENST00000502570 349 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC02235-201ENST00000534675 466 ntTSL 5 BASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MTATP6P25-201ENST00000574491 261 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC098848.2-201ENST00000588023 330 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 VN1R82P-201ENST00000601481 356 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR6767-201ENST00000637302 66 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 SAMD9-203ENST00000620985 6754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RNA5SP499-201ENST00000363982 119 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 Y_RNA.363-201ENST00000365529 113 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 MIR764-201ENST00000390811 85 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 LINC01701-201ENST00000419614 451 ntTSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC114737.2-201ENST00000421583 173 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC073127.1-201ENST00000447336 333 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
NEDD8Q15843 AC108078.2-201ENST00000510750 236 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
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