Protein–RNA interactions for Protein: Q15431

SYCP1, Synaptonemal complex protein 1, humanhuman

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Length 976 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP1Q15431 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORA70.7-201ENST00000384159 133 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC019176.1-201ENST00000518519 225 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 DEFB131E-202ENST00000602581 683 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 HSPE1P19-201ENST00000603327 295 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL158032.1-201ENST00000605401 106 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.17□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 SNORD114-26-201ENST00000363543 72 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 GDI2P2-201ENST00000445131 608 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MIR3937-201ENST00000580135 106 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 MIR4295-201ENST00000585286 85 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC022513.1-201ENST00000624512 117 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 AC013437.2-201ENST00000639587 677 ntBASIC1.16□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.22
SYCP1Q15431 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AP001136.1-201ENST00000425058 635 ntTSL 2 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 LINC01473-203ENST00000456653 1079 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL122001.1-201ENST00000457027 370 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC087343.1-201ENST00000477341 475 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNA5SP404-201ENST00000517118 132 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MTATP6P15-201ENST00000527233 835 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC100763.1-201ENST00000532735 522 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 SNORD114-21-201ENST00000606412 72 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MGAT4C-209ENST00000611864 25116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.15□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL445523.1-201ENST00000451184 1362 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RPS20P2-201ENST00000402520 389 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL390774.2-201ENST00000423942 788 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 KATNBL1P3-201ENST00000443475 909 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC022709.1-201ENST00000615967 87 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 OR4G3P-201ENST00000633500 913 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC104653.2-201ENST00000435407 416 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL157373.1-201ENST00000456036 276 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC107934.1-201ENST00000522215 217 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 CYP3A52P-201ENST00000563326 91 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC092296.3-201ENST00000589968 249 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AL158042.1-201ENST00000605338 460 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC107308.1-201ENST00000615897 301 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.13□□□□□ -2.23
SYCP1Q15431 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
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