Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 AC008121.3-201ENST00000618726 433 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 MIR6132-201ENST00000622083 109 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AP000553.5-201ENST00000641933 54 ntBASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.96□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.96□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AC087884.1-201ENST00000469738 328 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 AL138976.2-201ENST00000563989 694 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.95□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC1.95□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 SNORA69-201ENST00000383895 132 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 Y_RNA.436-201ENST00000384097 102 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 MIR221-201ENST00000385135 110 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 MIR561-201ENST00000385216 97 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AL117339.3-201ENST00000418733 162 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 VN1R108P-201ENST00000431580 830 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AL121601.2-201ENST00000438019 707 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.94□□□□□ -2.1
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RAB35Q15286 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 OR2L2-202ENST00000641771 4300 ntAPPRIS P1 BASIC1.93□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 Y_RNA.41-201ENST00000362646 102 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU4-52P-201ENST00000384209 138 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 SNORA11.4-201ENST00000408823 129 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AL365258.1-201ENST00000440885 247 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
RAB35Q15286 AL136972.1-201ENST00000443471 351 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
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