Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 BNIP3P31-201ENST00000604515 566 ntBASIC0□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNU1-119P-201ENST00000391122 165 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 RNA5SP111-201ENST00000411386 101 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 DPY19L1-208ENST00000612226 607 ntTSL 1 (best) BASIC-0.01□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 AC095057.3-201ENST00000567102 1157 ntBASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.02□□□□□ -2.41
SHPRHQ149N8 SPINK13-201ENST00000398450 509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC-0.02□□□□□ -2.41
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SHPRHQ149N8 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC-0.05□□□□□ -2.42
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SHPRHQ149N8 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 MIR214-201ENST00000385214 110 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 RNU6-1176P-201ENST00000390955 107 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 DHFRP6-201ENST00000401776 268 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
SHPRHQ149N8 RN7SKP142-201ENST00000411236 328 ntBASIC-0.06□□□□□ -2.42
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