Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC012312.1-201ENST00000503710 527 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 Y_RNA.655-201ENST00000515919 96 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AK6P1-201ENST00000540219 478 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 AL049779.4-201ENST00000604500 156 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
ALCAMQ13740 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1208P-201ENST00000459588 107 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC068781.1-201ENST00000488231 618 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL157687.1-201ENST00000554853 619 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC092807.2-201ENST00000609367 243 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC068137.3-201ENST00000639191 341 ntBASIC2.4□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 OR4G1P-203ENST00000641984 1631 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 Y_RNA.231-201ENST00000364358 102 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR514A2-201ENST00000385131 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR514A3-201ENST00000385132 88 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC091435.1-201ENST00000505442 584 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC107208.1-201ENST00000508265 519 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA31.11-201ENST00000516528 139 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR1273D-201ENST00000577266 86 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC2.39□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNA5SP425-201ENST00000410336 112 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 LINC01774-201ENST00000453569 595 ntTSL 2 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1069P-201ENST00000516612 133 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 DLX6-AS1_1.1-201ENST00000621599 180 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR6873-201ENST00000622788 63 ntBASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.38□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ZDBF2-202ENST00000611847 9890 ntTSL 5 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU1-148P-201ENST00000384472 162 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RNA5SP508-201ENST00000411327 119 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ERLEC1P1-201ENST00000433806 578 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC118273.2-201ENST00000532092 465 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 CYCSP26-201ENST00000534107 320 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AL121757.2-201ENST00000611223 313 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.37□□□□□ -2.03
ALCAMQ13740 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.36□□□□□ -2.03
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