Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 U3.12-201ENST00000364498 214 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MCF2-204ENST00000414978 3813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC113383.1-204ENST00000507060 552 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 PSMA3P-201ENST00000555485 635 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC104458.1-201ENST00000608243 463 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC008162.2-201ENST00000613352 291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.35□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 NDUFB4P4-201ENST00000404822 243 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC093249.1-201ENST00000567049 203 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 MIR6817-201ENST00000615588 66 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 HMGB1P24-202ENST00000615653 685 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.34□□□□□ -2.03
CUL3Q13618 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.34□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL445529.1-201ENST00000398713 389 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RPS29P25-201ENST00000481709 171 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MTND4LP26-201ENST00000518144 282 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR4658-201ENST00000584344 65 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC009314.1-201ENST00000603871 304 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC092794.1-201ENST00000612734 582 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 ZNRD1-AS1_2.5-201ENST00000614729 76 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 FAR1-204ENST00000532502 5820 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 SLC39A10-201ENST00000359634 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC2.33□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 WWP1-201ENST00000265428 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 C5orf46-201ENST00000318315 506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1252P-201ENST00000363054 104 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
CUL3Q13618 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.32□□□□□ -2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms