Protein–RNA interactions for Protein: Q13562

NEUROD1, Neurogenic differentiation factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 356 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEUROD1Q13562 MIR7-3-201ENST00000384898 110 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR1250-201ENST00000408098 113 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 TRAPPC2P10-201ENST00000415662 323 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MAMDC2-AS1-203ENST00000420573 339 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC005300.1-201ENST00000428401 373 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL078601.2-201ENST00000429444 474 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL049874.1-201ENST00000489560 388 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.662-201ENST00000516028 97 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC084851.1-201ENST00000529105 249 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AP001021.1-201ENST00000577704 244 ntTSL 3 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RPL23AP78-201ENST00000599928 470 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL161798.1-201ENST00000604630 131 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR4275-201ENST00000636486 87 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 GBE1-205ENST00000489715 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 CCDC141-202ENST00000409284 6960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.86□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL050331.3-201ENST00000448740 2081 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MGAT4C-211ENST00000621808 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU4-90P-201ENST00000362773 141 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 ATP6V0E1P4-201ENST00000427294 242 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC107934.2-201ENST00000518653 310 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC243829.5-201ENST00000578447 247 ntTSL 5 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC008121.1-201ENST00000603244 268 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC072026.1-201ENST00000605023 201 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 ERBIN-201ENST00000284037 8647 ntTSL 1 (best) BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RAD21-210ENST00000523986 2506 ntTSL 2 BASIC4.85□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SCEL-205ENST00000535157 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 HSPA4L-202ENST00000505726 2639 ntTSL 2 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 TUG1-202ENST00000521091 2110 ntTSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-1167P-201ENST00000363227 94 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR301A-201ENST00000385261 86 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC091390.3-201ENST00000426478 338 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 AC067852.4-201ENST00000590314 478 ntBASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.84□□□□□ -1.63
NEUROD1Q13562 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 ROCK1P1-203ENST00000608049 2457 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RNU6-1290P-201ENST00000362957 109 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 Y_RNA.81-201ENST00000362997 102 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AL513331.1-201ENST00000411908 397 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AL590399.6-201ENST00000446396 307 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RPL21P13-201ENST00000488305 481 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RTTN-201ENST00000255674 6960 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 SYNE2-212ENST00000554584 20508 ntTSL 5 BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 OR4G2P-202ENST00000641004 1759 ntBASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AL136537.2-201ENST00000562049 2471 ntTSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 FAM214A-216ENST00000619572 3548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.83□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 AGL-205ENST00000370163 7166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 MBNL1-206ENST00000357472 5256 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 MBNL1-223ENST00000498502 5258 ntTSL 5 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RBM39-201ENST00000253363 2488 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 PWAR6-201ENST00000552334 4618 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
NEUROD1Q13562 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.82□□□□□ -1.64
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