Protein–RNA interactions for Protein: Q13275

SEMA3F, Semaphorin-3F, humanhuman

Predictions only

Length 785 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3FQ13275 OSBPL6-201ENST00000190611 10513 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-918P-201ENST00000391219 106 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 PTMAP5-201ENST00000393073 333 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 UQCRBP2-201ENST00000447827 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RPS29P19-201ENST00000479709 171 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 RN7SL604P-201ENST00000492589 296 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC103726.1-201ENST00000520785 474 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC018448.1-201ENST00000552843 316 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 HSPE1P7-201ENST00000604681 321 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AL138686.1-201ENST00000612699 315 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC021753.1-201ENST00000635724 168 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 ABCA12-202ENST00000389661 7005 ntTSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LINC02471-203ENST00000641941 4752 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 LRRIQ3-204ENST00000395089 2673 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 BCHE-201ENST00000264381 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 MLH1-212ENST00000455445 2296 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.65
SEMA3FQ13275 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SLC10A2-201ENST00000245312 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.233-201ENST00000364407 101 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.498-201ENST00000384460 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RN7SKP53-201ENST00000411337 315 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC105398.1-201ENST00000446073 402 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC011824.2-201ENST00000579896 579 ntTSL 4 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RPS4XP16-203ENST00000596904 698 ntTSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 U6.106-201ENST00000636360 105 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ZNF254-202ENST00000357002 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.291-201ENST00000364886 113 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR23B-201ENST00000384832 97 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR134-201ENST00000385258 73 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL591034.1-201ENST00000407447 340 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 snoU13.28-201ENST00000459235 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNY3P16-201ENST00000516338 101 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR2114-201ENST00000516645 80 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC020891.1-201ENST00000558785 174 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 N4BP2L2-202ENST00000357505 2917 ntTSL 2 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 NFAT5-203ENST00000393742 13067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ASAH1-265ENST00000637922 2297 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 UBE4A-201ENST00000252108 6103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CDH10-201ENST00000264463 3438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU6-799P-201ENST00000363567 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU1-64P-201ENST00000365443 163 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 MIR513A2-201ENST00000385249 127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL512633.1-201ENST00000399931 655 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL138878.1-201ENST00000405131 347 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC097716.1-201ENST00000509136 180 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC007493.1-202ENST00000567899 517 ntTSL 2 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 RN7SL703P-201ENST00000578485 302 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CCDC30-203ENST00000428554 3063 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CLCA4-201ENST00000370563 3211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AL133383.2-201ENST00000622958 2336 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.69□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CCDC14-217ENST00000485727 7917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 CATSPERB-201ENST00000256343 3623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 ABCD2-201ENST00000308666 6238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
SEMA3FQ13275 Y_RNA.170-201ENST00000363746 110 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
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