Protein–RNA interactions for Protein: Q13224

GRIN2B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, humanhuman

Predictions only

Length 1,484 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2BQ13224 BNIP3P30-201ENST00000601184 574 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AP000860.1-201ENST00000605250 559 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC112220.3-201ENST00000605502 502 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL161716.1-201ENST00000606365 273 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC072039.2-201ENST00000608883 439 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092813.1-201ENST00000635455 969 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 FARSBP1-201ENST00000435808 1778 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 ZNF29P-201ENST00000225587 168 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 Y_RNA.33-201ENST00000362591 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNY3P13-201ENST00000365542 102 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-1000P-201ENST00000391066 106 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 UBE2V1P10-201ENST00000414685 269 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC092783.1-201ENST00000435832 231 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 ZNF736P4Y-201ENST00000454995 1243 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 XIRP2-AS1-201ENST00000525330 776 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC036111.3-201ENST00000526389 112 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC069061.2-202ENST00000580280 357 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 LINC01899-202ENST00000583756 575 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC005357.2-201ENST00000586473 583 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MIR15A-201ENST00000607334 83 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC091965.4-201ENST00000607691 587 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL355816.2-201ENST00000610049 647 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 AL138960.2-201ENST00000625145 535 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 MIR6866-201ENST00000638146 69 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
GRIN2BQ13224 SNORA4.1-201ENST00000364263 144 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 PTPRG-AS1-202ENST00000466893 823 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC099513.1-201ENST00000490423 301 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 PRKCQ-AS1-208ENST00000608453 587 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 PDCD6IPP1-201ENST00000615124 579 ntTSL 2 BASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC093648.1-201ENST00000623546 606 ntBASIC1.09□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 SNORD3E-201ENST00000362899 217 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU5E-6P-201ENST00000365574 115 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 ELOCP17-201ENST00000414751 326 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 ELOCP9-201ENST00000418624 239 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC217774.1-201ENST00000578936 517 ntTSL 4 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 hsa-mir-3130-1.1-201ENST00000579223 75 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC008993.2-201ENST00000631744 806 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 CALCRL-202ENST00000409998 5223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-439P-201ENST00000384188 106 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL109924.3-201ENST00000413324 393 ntTSL 2 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC009518.2-201ENST00000418056 731 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 Y_RNA.689-201ENST00000516589 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC023050.2-201ENST00000544968 387 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC078795.2-201ENST00000602835 1252 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 UGP2-231ENST00000627474 264 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC092104.1-201ENST00000497346 1441 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC099786.3-201ENST00000565735 1410 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 Y_RNA.46-201ENST00000362695 102 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-946P-201ENST00000383878 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AL161935.3-201ENST00000433770 347 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RPL23AP35-201ENST00000451906 501 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
GRIN2BQ13224 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.1 ms