Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 FDX1P2-201ENST00000450769 375 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 TH2LCRR-203ENST00000457489 439 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MRPS17P9-201ENST00000511924 393 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU4ATAC8P-201ENST00000516196 109 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AP001893.2-201ENST00000526949 202 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC009063.1-201ENST00000563342 702 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL354950.2-201ENST00000617939 290 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 YWHAEP7-203ENST00000622054 312 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 TFEC-204ENST00000457268 6309 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC009487.4-201ENST00000624969 3585 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORA64-201ENST00000384674 134 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.582-201ENST00000391023 95 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC005009.1-201ENST00000423979 269 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 HMGN2P19-201ENST00000425149 265 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC018816.1-203ENST00000441894 338 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 KCNQ5-IT1-201ENST00000445310 563 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MCHR2-AS1-203ENST00000451220 429 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC004930.1-201ENST00000470677 254 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MAGI1-AS1-201ENST00000472514 591 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORA31.16-201ENST00000516773 139 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC069120.1-201ENST00000521623 379 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.51-201ENST00000362725 102 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 XGY1-201ENST00000381172 446 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC008539.1-201ENST00000507653 482 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MRPL51-203ENST00000538814 501 ntTSL 2 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL118558.2-201ENST00000556294 238 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
ERCC8Q13216 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
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