Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL7P37-201ENST00000425095 738 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TTTY8-202ENST00000426035 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 GAS5-221ENST00000450589 632 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC012308.1-201ENST00000451232 178 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TTTY8B-202ENST00000455570 518 ntTSL 1 (best) BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TRBVA-201ENST00000498804 316 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC110799.1-201ENST00000509098 449 ntTSL 3 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC015818.4-201ENST00000580931 353 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC243960.4-201ENST00000600532 288 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL121917.1-203ENST00000605534 577 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC064859.1-201ENST00000624741 174 ntBASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.68□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CYLC2-201ENST00000374798 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORA67.4-201ENST00000384688 142 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 DEFB130A-201ENST00000400079 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL356057.3-201ENST00000402607 340 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL354751.2-201ENST00000415471 210 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC035139.1-201ENST00000423256 273 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 DEFB130B-201ENST00000437818 240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 OSTCP8-201ENST00000445117 448 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 HMGN1P10-201ENST00000474557 553 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MED28P2-201ENST00000475771 317 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 LINC02491-201ENST00000504710 403 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.701-201ENST00000516812 110 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 UQCRB-202ENST00000517523 515 ntTSL 2 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RPL23AP88-201ENST00000605759 454 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC084781.2-201ENST00000615568 161 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AK9-203ENST00000368948 2478 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MLF1-203ENST00000392822 2157 ntTSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.67□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNA5SP492-201ENST00000411330 114 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU5F-8P-201ENST00000515941 111 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SCARNA15.1-201ENST00000516384 125 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 RGS4-209ENST00000531057 544 ntTSL 4 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AP000889.2-201ENST00000532684 490 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
GRIK2Q13002 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.66□□□□□ -1.98
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