Protein–RNA interactions for Protein: Q12879

GRIN2A, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2A, humanhuman

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Length 1,464 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN2AQ12879 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.36□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU6-858P-201ENST00000362436 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNA5SP361-201ENST00000362686 118 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 SNORD51.1-201ENST00000365405 77 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 MIR217-201ENST00000384817 110 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 MTND2P6-201ENST00000455337 1030 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 HOTAIR_3.1-201ENST00000611352 97 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 PTPN22-206ENST00000525799 2118 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 SNORD56.4-201ENST00000363883 71 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 SNORD114-15-201ENST00000364687 72 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 LINC01866-201ENST00000421181 201 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC092264.1-201ENST00000456002 713 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC093809.1-201ENST00000509155 340 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU6-758P-201ENST00000516292 89 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNA5SP481-201ENST00000516814 122 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 UTP23-205ENST00000520733 369 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 AC104465.1-201ENST00000611365 139 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
GRIN2AQ12879 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR200A-201ENST00000384875 90 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RPS3AP37-201ENST00000419176 745 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL050338.2-202ENST00000431609 956 ntTSL 2 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTCO3P45-201ENST00000443036 613 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 HGF-207ENST00000453018 721 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 XACT-201ENST00000468762 497 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 HOXA11-AS1_6.1-201ENST00000620092 179 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Y_RNA.234-201ENST00000364409 97 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR605-201ENST00000385078 83 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RPS3AP1-201ENST00000413190 320 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC003991.1-202ENST00000447058 777 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 OFD1P7Y-201ENST00000454643 1155 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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GRIN2AQ12879 AC010183.2-202ENST00000546791 382 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC02461-201ENST00000553211 836 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC012414.2-201ENST00000559474 187 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
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GRIN2AQ12879 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC0.33□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
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GRIN2AQ12879 RNU6-188P-201ENST00000364207 107 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 BX119904.4-201ENST00000424402 301 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC104651.1-201ENST00000427559 735 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 TXNL1P1-201ENST00000429528 554 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL008723.1-201ENST00000452181 590 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
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GRIN2AQ12879 AC018659.1-201ENST00000551083 169 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC105129.3-201ENST00000605455 485 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-87P-201ENST00000607561 108 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC068506.1-202ENST00000613388 545 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 SYCP2-202ENST00000371001 5479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR194-1-201ENST00000384892 85 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 CETN4P-201ENST00000432407 469 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC099677.2-201ENST00000436385 175 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTCO3P42-201ENST00000509488 518 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC109454.3-201ENST00000512748 669 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 MTCO3P39-201ENST00000514812 518 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RNU6-143P-201ENST00000516942 93 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 LINC00301-204ENST00000532591 470 ntTSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC090680.2-201ENST00000550279 742 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
GRIN2AQ12879 AC015727.1-201ENST00000572792 512 ntTSL 5 BASIC0.31□□□□□ -2.36
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