Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 CALM2P2-201ENST00000428512 440 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTND5P25-201ENST00000430499 799 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 snoU13.15-201ENST00000459407 104 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC004223.1-201ENST00000479840 271 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AF131216.2-201ENST00000512316 564 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MTND3P5-201ENST00000512798 333 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AP000873.5-201ENST00000533906 236 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC007450.1-201ENST00000536492 188 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RRN3P3-201ENST00000549207 578 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.23□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 OR4C11-202ENST00000641580 2737 ntAPPRIS P1 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 PCDH9-AS3-201ENST00000434073 479 ntTSL 2 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RPS29P29-201ENST00000456396 171 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-311P-201ENST00000516224 102 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 RNU6-902P-201ENST00000517212 91 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 ASPH-224ENST00000522603 842 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AC008751.2-201ENST00000597885 980 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.22□□□□□ -2.21
IFFO1Q0D2I5 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-179P-201ENST00000363350 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 SNORA40.6-201ENST00000391153 128 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 MTND1P30-201ENST00000441241 901 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL591504.1-201ENST00000450681 414 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC091212.1-201ENST00000474798 395 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC091887.1-201ENST00000514002 439 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNA5SP445-201ENST00000515889 115 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC022878.1-201ENST00000530684 149 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 HMGN1P30-201ENST00000589286 268 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AP000240.1-201ENST00000609910 452 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC019226.2-201ENST00000625973 424 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC106754.1-201ENST00000562632 1513 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 C6orf62-201ENST00000378102 741 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-939P-201ENST00000384634 107 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL354692.1-201ENST00000423044 315 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC074344.1-201ENST00000512823 224 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 Y_RNA.672-201ENST00000516289 104 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC005668.1-201ENST00000571142 476 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 TUSC7.1-201ENST00000610969 165 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 AC099654.13-201ENST00000639774 207 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
IFFO1Q0D2I5 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms