Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP000936.1-201ENST00000442124 483 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPL7P12-201ENST00000446719 750 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC090515.1-201ENST00000465295 476 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORA19.2-201ENST00000516013 114 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC099520.1-206ENST00000523434 486 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ESF1-202ENST00000617257 1470 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 EIF4E2P1-201ENST00000393781 255 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPS3AP44-201ENST00000425466 790 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC079467.1-201ENST00000508512 503 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC083973.1-205ENST00000518994 601 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC090124.2-201ENST00000527727 563 ntTSL 4 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR4672-201ENST00000583126 81 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNORD14A-201ENST00000606526 91 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 FGF7-206ENST00000614567 3936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 USP53-202ENST00000450251 6072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU4-26P-201ENST00000410270 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 USP9YP8-201ENST00000441913 500 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU7-66P-201ENST00000459469 62 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 UBE2DNL-203ENST00000474922 222 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL160394.1-201ENST00000624765 724 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 RNA5SP37-201ENST00000365420 130 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 Y_RNA.500-201ENST00000384466 111 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 Y_RNA.573-201ENST00000384763 105 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC236972.1-201ENST00000433225 199 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC018634.1-201ENST00000437554 401 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC2.11□□□□□ -2.07
RBBP4Q09028 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.8 ms