Protein–RNA interactions for Protein: Q04844

CHRNE, Acetylcholine receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNEQ04844 GALP-203ENST00000590002 150 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SETDB2-202ENST00000317257 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 BCLAF1-202ENST00000392348 2610 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ADGRG7-202ENST00000475887 2035 ntTSL 2 BASIC3.7□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL357500.1-201ENST00000413004 279 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC125238.1-201ENST00000448842 249 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC007224.1-201ENST00000564410 144 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC011461.1-201ENST00000592671 357 ntTSL 3 BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL591034.3-201ENST00000605511 685 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ZYXP1-201ENST00000617638 118 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC068724.3-201ENST00000625906 87 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AGTR2-201ENST00000371906 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SYNE1-207ENST00000367255 27748 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AP001486.2-201ENST00000561652 5113 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TM4SF18-201ENST00000296059 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 IPO8P1-201ENST00000455509 3109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ANO3-204ENST00000531568 3117 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP399-201ENST00000364003 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP479-201ENST00000364858 117 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SNORD116-18-201ENST00000383961 92 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 NDUFB4P6-201ENST00000436819 366 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HMGB1P37-201ENST00000439613 609 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC114741.1-201ENST00000504357 464 ntTSL 2 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR2116-201ENST00000517221 80 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AP005062.1-201ENST00000581502 607 ntTSL 3 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL020997.2-201ENST00000602607 184 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL391684.1-201ENST00000416191 2998 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 EVI5-208ENST00000540033 7436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SRP72P2-201ENST00000344851 1979 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 CFAP44-202ENST00000393845 7069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SYTL2-203ENST00000359152 4123 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-600P-201ENST00000362524 99 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-81P-201ENST00000365608 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RNU6-213P-201ENST00000384051 104 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 EI24P2-201ENST00000397776 1076 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RPL37P4-201ENST00000448908 268 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 FPGT-203ENST00000467578 601 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC027288.1-203ENST00000552167 567 ntTSL 4 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 HSPE1P5-201ENST00000561489 272 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC092326.1-201ENST00000567465 674 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 YWHAEP7-201ENST00000617508 639 ntTSL 3 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 U6.98-201ENST00000637157 84 ntBASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 KNTC1-204ENST00000436959 2412 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 RAP2C-AS1-202ENST00000441399 3473 ntTSL 2 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 MUC19-205ENST00000454784 24775 ntTSL 5 BASIC3.67□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC3.66□□□□□ -1.82
CHRNEQ04844 FAM126A-204ENST00000432176 13177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.4 ms