Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AL645944.1-201ENST00000603857 493 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC090425.1-201ENST00000610007 140 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 MIR8057-201ENST00000620957 69 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 CCDC82-201ENST00000278520 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 BMP5-201ENST00000370830 3952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 EXOC6-203ENST00000371552 3564 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RNF219-AS1-214ENST00000607862 6001 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 FAM214A-204ENST00000546305 3697 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 MIR422A-201ENST00000362286 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 Z98749.2-208ENST00000381646 500 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RNU1-101P-201ENST00000391171 127 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 HIST1H2APS3-201ENST00000403259 134 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RN7SKP58-201ENST00000411010 305 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 CFAP44-AS1-201ENST00000473329 396 ntTSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 LIPI-203ENST00000536861 1529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 RNU6-72P-201ENST00000384285 79 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
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PGGT1BP53609 U91324.1-201ENST00000442864 447 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RPL27AP5-201ENST00000469428 449 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
PGGT1BP53609 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
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