Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC023490.1-201ENST00000614584 375 ntTSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC011718.1-201ENST00000622906 375 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC027514.1-201ENST00000588561 1603 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 KNL1-204ENST00000527044 5404 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 OR4G2P-201ENST00000328113 903 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MT-CYB-201ENST00000361789 1141 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MIR412-201ENST00000362142 91 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-1303P-201ENST00000364841 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC012370.1-201ENST00000419244 530 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 PCDH9-AS1-201ENST00000430861 532 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTCO3P5-201ENST00000433620 714 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 CYP2C59P-201ENST00000457790 269 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC023794.1-201ENST00000504210 403 ntTSL 2 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC021242.2-203ENST00000521842 687 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC133480.1-201ENST00000547563 381 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 HSBP1P1-201ENST00000555205 166 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC087683.1-201ENST00000591187 441 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC087045.1-201ENST00000605856 382 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC004908.3-201ENST00000610248 625 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC072046.2-201ENST00000618366 268 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 USP12-203ENST00000620323 349 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 CFHR4-204ENST00000608469 1601 ntTSL 1 (best) BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.194-201ENST00000363985 102 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.224-201ENST00000364308 111 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SNORD14B-201ENST00000364533 90 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-108P-201ENST00000365558 107 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 NDUFB1P2-201ENST00000449477 176 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTND2P33-201ENST00000506452 1031 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-405P-201ENST00000516637 110 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 UHRF1BP1L-203ENST00000545232 4088 ntTSL 1 (best) BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
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HOXD10P28358 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTATP6P3-201ENST00000581686 676 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC2.04□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SERPINI2-202ENST00000461846 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-1287P-201ENST00000362914 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 RNU6-1060P-201ENST00000384664 107 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 FGFR1OP2P1-201ENST00000395943 500 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 OR6C66P-201ENST00000414917 930 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL139397.1-201ENST00000430456 644 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 SMAD1-AS2-201ENST00000508936 1090 ntTSL 1 (best) BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC2.03□□□□□ -2.08
HOXD10P28358 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC2.03□□□□□ -2.08
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