Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 CPSF6-207ENST00000551516 234 ntTSL 2 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC005730.3-201ENST00000583067 366 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SCARNA4-201ENST00000629045 128 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 TPTEP1-208ENST00000636884 213 ntBASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.18□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-601P-201ENST00000384540 107 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU4-14P-201ENST00000410858 122 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 PARP1P2-201ENST00000556806 195 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC018462.2-201ENST00000605375 395 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR7851-201ENST00000610611 160 ntBASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC2.17□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 NEB-203ENST00000397345 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 NEB-209ENST00000427231 26202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 KNL1-202ENST00000399668 7607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RGS4-201ENST00000367906 930 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORA56-201ENST00000383966 129 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RN7SKP111-201ENST00000410349 271 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Y_RNA.594-201ENST00000410373 140 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 RPL37P10-201ENST00000412884 288 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 LINC01423-202ENST00000436845 423 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ATP2B2-IT1-201ENST00000440152 472 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 Y_RNA.691-201ENST00000516611 103 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AC136624.4-201ENST00000573044 370 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 MIR4443-201ENST00000585052 53 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 AL355073.2-201ENST00000612106 557 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 FGF7-201ENST00000267843 5467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 ZNF271P-202ENST00000465539 1970 ntBASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.16□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.06
VPREB1P12018 GAGE12B-201ENST00000361446 117 ntAPPRIS P1 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.48-201ENST00000362710 103 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA72.1-201ENST00000363485 129 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 DEFB134-201ENST00000382205 314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 MIR524-201ENST00000385242 87 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL035423.1-201ENST00000420331 213 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 CST9LP2-201ENST00000437612 320 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RN7SKP18-201ENST00000516005 275 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC064807.2-201ENST00000521188 672 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 RPL12P50-201ENST00000603116 116 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
VPREB1P12018 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.15□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.1 ms