Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 ZNF510-201ENST00000223428 5154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC139713.2-215ENST00000641428 5037 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 COPG2-201ENST00000330992 3073 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 ADNP-201ENST00000349014 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MACC1-205ENST00000589011 2686 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR331-201ENST00000362302 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-454P-201ENST00000364292 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.281-201ENST00000364774 94 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PPIAP31-201ENST00000405422 495 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SNORA74C-2-201ENST00000411179 201 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AP000844.1-201ENST00000446631 577 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC100871.2-201ENST00000522005 327 ntTSL 3 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CEP152-203ENST00000399334 5097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC118758.3-201ENST00000624628 24137 ntTSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 KATNAL1-201ENST00000380615 7551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RAD17-208ENST00000380774 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SPEF2-216ENST00000637569 7350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC01355-201ENST00000566551 5444 ntBASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.58□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 PRG4-203ENST00000367485 4765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SLC30A6-205ENST00000435660 4776 ntTSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MMP16-201ENST00000286614 11558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-1205P-201ENST00000363625 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.456-201ENST00000384232 111 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU1-13P-201ENST00000384499 162 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR518D-201ENST00000385014 87 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-554P-201ENST00000410466 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU2-68P-201ENST00000410878 191 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC069285.2-201ENST00000440210 275 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP446-201ENST00000515955 82 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-412P-201ENST00000516434 106 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SNORA70.24-201ENST00000517233 118 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC068992.1-201ENST00000521411 543 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 TRAV8-5-201ENST00000537369 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 FAM27D1-201ENST00000612308 341 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC091905.2-201ENST00000623143 306 ntBASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 FMNL2-202ENST00000475377 3648 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 KCNJ6-201ENST00000609713 19645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 WDR49-207ENST00000479765 2108 ntTSL 2 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 XIRP2-207ENST00000628543 12182 ntTSL 5 BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 NUP205-201ENST00000285968 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RWDD2B-207ENST00000493196 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.57□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 OR56A3-205ENST00000641905 4595 ntAPPRIS P1 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RIMS1-204ENST00000401910 3542 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 USP34-201ENST00000398571 11357 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC092435.4-201ENST00000623012 4159 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 C6orf10-209ENST00000612031 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR383-201ENST00000362257 73 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 U8.1-201ENST00000362843 134 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNA5SP307-201ENST00000362863 116 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-49P-201ENST00000384256 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 TRAPPC2P9-201ENST00000434556 343 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RNU6-703P-201ENST00000516946 107 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 KIRREL3-AS2-201ENST00000532988 492 ntTSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR4724-201ENST00000579485 89 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MSANTD4-206ENST00000617528 508 ntTSL 5 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR7154-201ENST00000620673 73 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 MIR1245B-201ENST00000636115 69 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 RACGAP1-202ENST00000427314 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 AL133243.3-201ENST00000617415 3004 ntBASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 SERPINA7-201ENST00000327674 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 CCSER2-210ENST00000543283 5888 ntTSL 2 BASIC4.56□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.55□□□□□ -1.68
SOBPA7XYQ1 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.55□□□□□ -1.68
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