Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-467P-201ENST00000517027 110 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC009093.3-203ENST00000565800 121 ntTSL 2 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.11□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MT-CO2-201ENST00000361739 684 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-492P-201ENST00000363035 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA27.3-201ENST00000364937 134 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRAJ54-201ENST00000390484 60 ntAPPRIS P1 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB4XP8-201ENST00000402089 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P31-201ENST00000402702 684 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL355796.1-201ENST00000406706 323 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB4XP6-201ENST00000415187 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TMSB4XP1-201ENST00000424567 135 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC113331.1-201ENST00000428160 869 ntTSL 2 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC044784.2-201ENST00000447297 366 ntTSL 3 BASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RPL37P6-201ENST00000460682 294 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC118282.2-201ENST00000508739 374 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTATP6P9-201ENST00000515039 680 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RN7SKP258-201ENST00000517151 304 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP003327.1-201ENST00000529684 127 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4452-201ENST00000583004 71 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC-0.12□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU1-96P-201ENST00000364163 162 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU4-67P-201ENST00000364569 141 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUGT1P1-201ENST00000379514 476 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-114P-201ENST00000384704 105 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CALM2P3-201ENST00000400429 449 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL365434.1-201ENST00000412362 380 ntTSL 3 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01717-201ENST00000415754 527 ntTSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTCO2P5-201ENST00000422621 426 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL049830.1-201ENST00000468034 425 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC02201-201ENST00000508992 468 ntTSL 2 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-1223P-201ENST00000517124 104 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC-0.13□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TSPAN19-204ENST00000532498 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC-0.13□□□□□ -2.43
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FNDC1-IT1-201ENST00000419703 516 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAC1P6-201ENST00000423911 575 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LINC01673-201ENST00000426418 468 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 LARP1BP3-201ENST00000437229 869 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL606517.1-201ENST00000446914 387 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNRPGP12-201ENST00000449481 213 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4637-201ENST00000582405 84 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIR4769-201ENST00000584126 77 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC091805.2-201ENST00000603848 235 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC-0.14□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC-0.15□□□□□ -2.43
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