Protein–RNA interactions for Protein: Q9P0V3

SH3BP4, SH3 domain-binding protein 4, humanhuman

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Length 963 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4Q9P0V3 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.715-201ENST00000517082 110 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC131281.1-201ENST00000522984 164 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 LINC00508-201ENST00000538901 194 ntTSL 5 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 LINC02309-201ENST00000553679 207 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 SMIM2-AS1-204ENST00000619472 746 ntTSL 3 BASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.1□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 PHF6-205ENST00000625464 4434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-942P-201ENST00000363002 107 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-238P-201ENST00000363313 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RPL32P35-201ENST00000415214 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC073910.1-201ENST00000445047 438 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 MTATP6P7-201ENST00000453315 681 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC093663.1-201ENST00000497190 394 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC009812.2-201ENST00000517657 457 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC245166.1-201ENST00000521012 253 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC090985.1-201ENST00000554440 480 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC012468.1-201ENST00000604888 430 ntBASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 AC092636.1-201ENST00000608609 415 ntTSL 2 BASIC3.09□□□□□ -1.91
SH3BP4Q9P0V3 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC3.09□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LPP-221ENST00000618621 18277 ntTSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LPP-222ENST00000640853 18277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Y_RNA.210-201ENST00000364161 110 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL365277.2-201ENST00000415255 551 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 TOMM20P4-201ENST00000427861 435 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 RPL21P10-201ENST00000463521 490 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LINC02494-201ENST00000509824 427 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC3.08□□□□□ -1.92
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SH3BP4Q9P0V3 AC006600.1-201ENST00000572529 153 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC019176.2-201ENST00000611579 315 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA4-202ENST00000625402 129 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC007218.2-201ENST00000636913 179 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 U6.99-201ENST00000637524 83 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC3.08□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-472P-201ENST00000384299 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 DEFB116-201ENST00000400549 309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 GYPB-201ENST00000429670 239 ntTSL 1 (best) BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AL023693.1-201ENST00000434255 216 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 FCF1P4-201ENST00000448326 183 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 LINC02122-201ENST00000511395 577 ntTSL 4 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 MIR4782-201ENST00000577987 79 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 AC009271.1-202ENST00000588803 492 ntTSL 3 BASIC3.07□□□□□ -1.92
SH3BP4Q9P0V3 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC3.07□□□□□ -1.92
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