Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUQ8

ABCF3, ATP-binding cassette sub-family F member 3, humanhuman

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCF3Q9NUQ8 NCOA7-AS1-201ENST00000429007 501 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL441989.1-201ENST00000454204 382 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC025755.1-201ENST00000521306 278 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AP005597.4-201ENST00000526762 229 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MIR3941-201ENST00000582572 103 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 HNRNPDLP4-201ENST00000605144 301 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC005000.2-201ENST00000605468 310 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RMST_4.1-201ENST00000616886 107 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MIR6134-201ENST00000617606 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC138627.2-201ENST00000624202 601 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC006386.2-201ENST00000624491 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC012005.1-201ENST00000624575 75 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 OR51A4-201ENST00000380373 1002 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Y_RNA.419-201ENST00000384041 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC007560.1-201ENST00000426912 237 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL024508.1-201ENST00000432477 505 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC025750.2-201ENST00000442609 450 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Y_RNA.632-201ENST00000459189 102 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC008526.1-201ENST00000509149 338 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC092746.1-201ENST00000542819 562 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
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ABCF3Q9NUQ8 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC016727.1-205ENST00000605437 569 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 CAPS2-203ENST00000393284 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AKAP9-203ENST00000359028 12247 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 PCM1-222ENST00000524226 5955 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ABCF3Q9NUQ8 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SNORA40C-201ENST00000391285 128 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
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ABCF3Q9NUQ8 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 BTF3P15-201ENST00000455606 336 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC121154.1-201ENST00000507299 430 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 LINC02118-202ENST00000510583 419 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MIR892C-201ENST00000516410 77 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 CYCSP39-201ENST00000565821 309 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC113139.1-201ENST00000605049 239 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RNU4-76P-201ENST00000364509 141 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 Y_RNA.623-201ENST00000411128 95 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 NCOR1P3-201ENST00000420479 303 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC002386.1-201ENST00000436714 398 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL078601.1-201ENST00000444542 271 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 TSPY5P-202ENST00000456541 142 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 MIR4719-201ENST00000585233 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ABCF3Q9NUQ8 AL353621.2-201ENST00000605340 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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