Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ3

CCL28, C-C motif chemokine 28, humanhuman

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL28Q9NRJ3 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 IGKV3-31-201ENST00000523109 329 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 LINC02545-201ENST00000525381 306 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 DEUP1-203ENST00000527307 767 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 NTS-203ENST00000551529 801 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC090115.3-201ENST00000553218 849 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 NDUFAF4P1-201ENST00000559425 519 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC005909.1-201ENST00000577835 755 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR4424-201ENST00000585257 86 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR6895-201ENST00000613497 78 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC048344.4-201ENST00000619744 527 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 ZBED5-202ENST00000432999 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SCN7A-206ENST00000619410 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SCN7A-207ENST00000621965 7186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-259P-201ENST00000383999 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL023284.1-201ENST00000403956 276 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SUMO2P12-201ENST00000405924 140 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL445989.1-202ENST00000418943 776 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 PLCE1-AS2-203ENST00000433038 396 ntTSL 2 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC093534.1-201ENST00000504977 132 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SNORA31.25-201ENST00000517242 134 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL160281.1-201ENST00000605307 311 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 LINC00305-201ENST00000323355 873 ntTSL 1 (best) BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-944P-201ENST00000364023 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AFDN-AS1-202ENST00000417244 182 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL445123.1-201ENST00000422023 446 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL162400.2-201ENST00000427547 157 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 DNAJC19P4-201ENST00000440115 345 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RN7SL274P-201ENST00000492268 272 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 CYCSP27-201ENST00000527643 293 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC024909.2-201ENST00000553035 286 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC121758.2-201ENST00000553271 193 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 OR11H5P-201ENST00000554039 926 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AP005671.1-201ENST00000581798 463 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR4448-201ENST00000584360 86 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 ZNF788-206ENST00000596883 692 ntTSL 3 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SNRPGP19-201ENST00000603826 189 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC107304.1-201ENST00000604229 296 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 AC009090.3-201ENST00000616553 565 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 MIR6863-201ENST00000636112 90 ntBASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC1.63□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-525P-201ENST00000363685 104 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.481-201ENST00000384373 102 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
CCL28Q9NRJ3 Y_RNA.559-201ENST00000384686 107 ntBASIC1.62□□□□□ -2.15
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