Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ31

KCNS3, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 3, humanhuman

Predictions only

Length 491 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNS3Q9BQ31 RNU6-78P-201ENST00000362897 107 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC063965.1-201ENST00000416679 499 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 C1DP2-201ENST00000418167 426 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL162734.1-201ENST00000432858 157 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTND3P25-201ENST00000509243 135 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MIR3683-201ENST00000580847 82 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AP001485.1-201ENST00000604799 199 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 SAGE1-202ENST00000370709 2879 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-661P-201ENST00000362409 107 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.140-201ENST00000363474 103 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNY1P12-201ENST00000364251 105 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.576-201ENST00000384781 102 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU2-3P-201ENST00000410144 191 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU2-8P-201ENST00000410727 190 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP51-201ENST00000410781 304 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC003985.1-201ENST00000414127 362 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC112518.1-201ENST00000436089 575 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF736P8Y-201ENST00000451913 669 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU7-125P-201ENST00000458760 62 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC023790.1-201ENST00000482174 347 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC090572.1-201ENST00000519251 160 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AP003730.2-202ENST00000527281 774 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AP000648.3-201ENST00000623539 4507 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-553P-201ENST00000364047 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 SNORD115-7-201ENST00000365306 82 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP100-201ENST00000410903 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNA5SP59-201ENST00000410922 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-387P-201ENST00000411331 105 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 BTF3L4P1-201ENST00000413813 468 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC133106.1-201ENST00000419029 397 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL135908.1-201ENST00000431394 446 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC092436.2-201ENST00000515188 411 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-759P-201ENST00000516740 103 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 5S_rRNA.3-201ENST00000517021 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-232P-201ENST00000517144 64 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AP002453.2-201ENST00000533503 320 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MTND1P24-201ENST00000552175 861 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC008015.1-201ENST00000555505 465 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC005154.1-222ENST00000579024 341 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 5S_rRNA.19-201ENST00000612131 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 5S_rRNA.18-201ENST00000621941 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC138649.3-201ENST00000622154 254 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL391262.2-201ENST00000622466 494 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AC079248.2-201ENST00000623779 326 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 HIF1A-212ENST00000557538 3468 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 ZBTB8OS-201ENST00000341885 312 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNY4P34-201ENST00000364779 95 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 AL031577.2-201ENST00000404133 280 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RNU6-195P-201ENST00000411352 109 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
KCNS3Q9BQ31 RN7SKP101-201ENST00000411376 320 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 116.5 ms