Protein–RNA interactions for Protein: Q96LT4

SAMD8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAMD8Q96LT4 AC121247.2-201ENST00000604776 136 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC073114.1-201ENST00000612027 490 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC006355.2-201ENST00000629240 317 ntTSL 3 BASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC1.92□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 ZNF736P3Y-201ENST00000428264 1465 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-1120P-201ENST00000362988 108 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 TRAJ50-201ENST00000390487 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNA5SP338-201ENST00000410495 85 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL137856.1-202ENST00000418238 422 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 MTND4P32-201ENST00000437189 1237 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC092436.1-201ENST00000506450 503 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC104663.1-201ENST00000508555 557 ntTSL 2 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-430P-201ENST00000517078 107 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 COPS8P3-201ENST00000526024 482 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC026464.5-201ENST00000562497 722 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNASEH2B-AS1-206ENST00000601286 657 ntTSL 5 BASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.91□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.1
SAMD8Q96LT4 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SNORA16.2-201ENST00000390991 127 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU2-40P-201ENST00000410833 196 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 ATP13A5-AS1-201ENST00000414634 476 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MTATP6P18-201ENST00000417994 673 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 Z98742.3-201ENST00000418637 326 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RPL23AP42-201ENST00000471152 471 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC008549.1-201ENST00000512900 643 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC091544.4-201ENST00000555268 342 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MTCO3P23-201ENST00000561363 289 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC008088.1-201ENST00000580993 280 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 APOOP1-201ENST00000604695 592 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 OR5M1-202ENST00000641076 4302 ntAPPRIS P1 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 PTPRQ-208ENST00000614701 8289 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC1.9□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MTND4P1-201ENST00000457501 1466 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.399-201ENST00000383955 105 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC004870.3-202ENST00000412996 432 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 TTTY3-201ENST00000417334 344 ntTSL 1 (best) BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 MTCO2P11-201ENST00000431069 680 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 LINC02195-201ENST00000443373 294 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AP000431.2-201ENST00000450653 790 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 RPS27AP8-201ENST00000452665 445 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 BET1P1-201ENST00000482276 359 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 ARL2BPP4-201ENST00000506854 471 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 Y_RNA.695-201ENST00000516715 107 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 SNORA25.17-201ENST00000517184 124 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC022880.1-201ENST00000534017 973 ntBASIC1.89□□□□□ -2.11
SAMD8Q96LT4 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC1.89□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms