Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 OXR1-206ENST00000449762 2621 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 C6orf10-202ENST00000375015 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 METTL18-201ENST00000303469 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-790P-201ENST00000384479 105 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SNORA1.3-201ENST00000384676 136 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC026355.1-201ENST00000423466 587 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC096644.2-201ENST00000429278 159 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 PIGFP3-201ENST00000441918 722 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AL583843.1-201ENST00000456070 346 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 KC877373.1-201ENST00000479066 408 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RPL30P14-201ENST00000482744 348 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC087749.2-201ENST00000583910 352 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 HIKESHI-208ENST00000618164 499 ntTSL 5 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 OR4C15-202ENST00000642128 951 ntAPPRIS P1 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RGS22-214ENST00000523287 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 AC007785.2-201ENST00000598627 1916 ntBASIC2.97□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.93
ZNF548Q8NEK5 RAPGEF6-202ENST00000308008 4176 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 IL6ST-205ENST00000381294 2574 ntTSL 1 (best) BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CDC27P3-201ENST00000635418 1910 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MT-TG-201ENST00000387429 68 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC007919.1-201ENST00000429380 217 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CEP57L1P1-201ENST00000430943 1201 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Z82210.1-201ENST00000440037 231 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 HIGD1AP2-201ENST00000446367 280 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL590664.1-201ENST00000448065 339 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPL23AP45-201ENST00000476406 468 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPL30P5-201ENST00000494923 336 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.19-201ENST00000517079 126 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP165-201ENST00000517142 115 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP291-201ENST00000517222 105 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 CASP1P1-201ENST00000526345 212 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR3976-201ENST00000606807 139 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 MIR4272-201ENST00000635924 64 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LCOR-205ENST00000421806 16004 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 LINC00862-202ENST00000367356 759 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL109914.1-201ENST00000414740 146 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 PGBD4P6-201ENST00000421501 610 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL513043.1-201ENST00000439124 535 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AL031274.1-201ENST00000450334 232 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 SPAG11B-206ENST00000458665 444 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC010655.3-201ENST00000478818 450 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC105758.1-201ENST00000506038 399 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
ZNF548Q8NEK5 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
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