Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Q1

CHCHD4, Mitochondrial intermembrane space import and assembly protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHCHD4Q8N4Q1 AP003392.2-201ENST00000527269 208 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL135746.1-201ENST00000554205 547 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RSL24D1P11-201ENST00000591045 491 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 LINC00907-210ENST00000593316 847 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL589765.7-201ENST00000601684 629 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC2.24□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 ATP8A2P2-201ENST00000437678 1568 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MIR29B2-201ENST00000385055 81 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-550P-201ENST00000391057 101 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC083900.1-201ENST00000421964 469 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 USP9YP18-201ENST00000425912 695 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01256-201ENST00000513270 508 ntTSL 2 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC004054.1-201ENST00000515111 270 ntTSL 3 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.687-201ENST00000516558 91 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4498-201ENST00000577599 66 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC002984.1-201ENST00000591692 448 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC008945.2-201ENST00000606056 604 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 HOTAIRM1_5.1-201ENST00000619311 145 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC099842.1-201ENST00000619919 596 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 CYP3A43-217ENST00000631161 328 ntTSL 5 BASIC2.23□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 RNU1-17P-201ENST00000363022 152 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 ATP6V0E1P3-201ENST00000420036 246 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CHCHD4Q8N4Q1 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 MGC32805-203ENST00000506053 652 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC097467.1-201ENST00000513660 370 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
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CHCHD4Q8N4Q1 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC2.22□□□□□ -2.05
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CHCHD4Q8N4Q1 AC026585.1-201ENST00000619582 524 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC009831.4-201ENST00000620744 325 ntBASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SRP54-214ENST00000630962 162 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 LRIF1-203ENST00000494675 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.22□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.05
CHCHD4Q8N4Q1 AC005336.3-201ENST00000623833 2679 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 LRRC69-201ENST00000343709 720 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.359-201ENST00000365498 102 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA75-201ENST00000384158 137 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-1042P-201ENST00000384204 107 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RAP1BP3-201ENST00000407180 549 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL162254.1-202ENST00000419604 497 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL031667.1-201ENST00000440222 725 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MTND2P22-201ENST00000444325 1033 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC069542.1-201ENST00000445235 557 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC097460.1-201ENST00000514624 590 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC009135.1-201ENST00000549303 776 ntTSL 2 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC009269.3-201ENST00000558429 472 ntTSL 5 BASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AC011494.1-201ENST00000596454 237 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.21□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-371P-201ENST00000364283 108 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU6-45P-201ENST00000384471 107 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SNORA26.9-201ENST00000391322 122 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 RNU4-46P-201ENST00000410818 138 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
CHCHD4Q8N4Q1 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC2.2□□□□□ -2.06
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