Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 SGIP1-206ENST00000435165 3646 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MUC7-202ENST00000413702 2540 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 TNPO1P3-201ENST00000436471 2662 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RNU6-222P-201ENST00000362438 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 SNORD6-201ENST00000365444 73 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RNVU1-14-201ENST00000384770 164 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MT-TW-201ENST00000387382 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MIR1302-6-201ENST00000408466 90 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 TAB3-AS1-201ENST00000428263 245 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 BX679664.1-201ENST00000434429 253 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RNU7-170P-201ENST00000459303 61 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 LINC02374-202ENST00000515222 578 ntTSL 4 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RNA5SP164-201ENST00000516533 110 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC023157.2-201ENST00000540596 141 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AL133383.1-201ENST00000569292 901 ntTSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MIR5187-201ENST00000583479 76 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MIR3922-201ENST00000585192 84 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MIR7975-201ENST00000619350 68 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 DTWD1-201ENST00000251250 13776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 CYYR1-AS1-201ENST00000357401 3412 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 MMS22L-202ENST00000369251 3949 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
USP53Q70EK8 RAB3C-201ENST00000282878 8896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-1301P-201ENST00000362724 104 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNA5SP51-201ENST00000364750 119 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.376-201ENST00000365638 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 TRAJ18-201ENST00000390519 66 ntAPPRIS P1 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 SNORA26.3-201ENST00000391119 136 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 U7.8-201ENST00000619968 63 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL136164.4-201ENST00000625013 2135 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 MIR181A1HG-203ENST00000436880 2308 ntTSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 LINC00890-202ENST00000569275 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 SPINK1-201ENST00000296695 542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.105-201ENST00000363182 111 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.483-201ENST00000384380 101 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU6-748P-201ENST00000384648 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL135923.2-201ENST00000435444 501 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL583835.2-201ENST00000435483 500 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 RNU5B-3P-201ENST00000516601 115 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 POC1B-211ENST00000549504 581 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC104564.2-201ENST00000581240 270 ntTSL 3 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AL359962.2-201ENST00000610044 303 ntTSL 5 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC012531.5-201ENST00000611375 151 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC006111.3-201ENST00000622137 383 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 ZNF415-207ENST00000595193 2479 ntTSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 TET2-204ENST00000413648 4973 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 OSBPL8-202ENST00000393249 7047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
USP53Q70EK8 CASP1-201ENST00000353247 423 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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