Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AL023581.1-201ENST00000423500 455 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AL358075.2-201ENST00000452785 339 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 RPL30P6-201ENST00000475925 342 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC008834.1-201ENST00000511612 175 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 SCARNA24.1-201ENST00000516465 137 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC025871.1-201ENST00000523935 443 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC130415.1-201ENST00000547569 1010 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC123905.1-201ENST00000552098 541 ntTSL 4 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC103810.8-201ENST00000607347 118 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 MALAT1-207ENST00000613376 132 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 MIR7111-201ENST00000619751 72 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC023510.2-201ENST00000622162 746 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
ZBED9Q6R2W3 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 DEFB114-201ENST00000322066 253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.22-201ENST00000362492 102 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU1-22P-201ENST00000363334 158 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 SNORA20.2-201ENST00000383922 131 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.508-201ENST00000384502 114 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR95-201ENST00000385072 81 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.598-201ENST00000410480 95 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU2-39P-201ENST00000410604 198 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC092608.1-201ENST00000503505 267 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC108935.1-201ENST00000504874 518 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC112206.3-201ENST00000514578 389 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 FABP5P5-201ENST00000515537 406 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 ADI1P3-201ENST00000549509 470 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC007631.1-201ENST00000578545 189 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC091304.9-201ENST00000612091 226 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC012409.4-201ENST00000612923 249 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 ZFAT-AS1_2.1-201ENST00000613742 201 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 ATM-228ENST00000639240 498 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 CEP290-201ENST00000309041 7616 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LRRIQ1-202ENST00000393217 5394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.118-201ENST00000363300 101 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU6-1179P-201ENST00000384667 107 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR558-201ENST00000384920 94 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR10A-201ENST00000385043 110 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MT-TH-201ENST00000387441 69 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RPL23AP32-201ENST00000395315 459 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00301-202ENST00000412599 772 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL031779.1-201ENST00000415663 330 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL365338.1-201ENST00000422282 858 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 CYCSP46-201ENST00000423569 204 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC137499.1-201ENST00000427602 88 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC025038.1-201ENST00000433249 336 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL445567.1-201ENST00000439121 144 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL022238.1-201ENST00000442557 355 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 CSN1S2AP-201ENST00000451783 779 ntTSL 1 (best) BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTCYBP1-201ENST00000454315 1119 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LINC00894-208ENST00000455777 284 ntTSL 2 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.717-201ENST00000517106 92 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC090049.1-201ENST00000551075 1011 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AC022254.1-201ENST00000567857 235 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 AL157786.1-207ENST00000627771 695 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 MTND4P4-201ENST00000439033 1366 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 LIPJ-201ENST00000371939 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 TEX21P-201ENST00000447107 1476 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU6-169P-201ENST00000365336 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 TRAV40-201ENST00000390467 317 ntAPPRIS P1 BASIC1.38□□□□□ -2.19
ZBED9Q6R2W3 SNORA40.3-201ENST00000390964 122 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
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