Protein–RNA interactions for Protein: Q6IQ19

CCSAP, Centriole, cilia and spindle-associated protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAPQ6IQ19 AP003033.1-201ENST00000527244 415 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AL713866.2-201ENST00000603579 219 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 MARCH7-202ENST00000409175 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.17□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 MIR196B-201ENST00000384852 84 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 VN1R36P-201ENST00000414936 291 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AC005482.1-201ENST00000420758 575 ntTSL 4 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AL121890.1-201ENST00000435457 205 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP217-201ENST00000515959 91 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 ZRANB2-AS2-213ENST00000591654 719 ntTSL 5 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 CASC1-205ENST00000545133 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.16□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 ZNF280D-204ENST00000558320 3666 ntTSL 1 (best) BASIC3.15□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC3.15□□□□□ -1.9
CCSAPQ6IQ19 RPL9P7-201ENST00000330965 580 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 VTRNA1-1-201ENST00000363120 99 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 ZNF885P-201ENST00000420174 1098 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL161935.1-201ENST00000420945 421 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC009233.1-201ENST00000616477 371 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC009033.1-201ENST00000624279 431 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-256P-201ENST00000516747 97 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AP001836.1-201ENST00000604675 523 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL159153.1-201ENST00000619688 317 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 GCNT4-201ENST00000322348 5554 ntAPPRIS P1 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-859P-201ENST00000362728 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNA5SP68-201ENST00000363885 119 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 GSTA3-202ENST00000370968 775 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 IMMP1LP2-201ENST00000552954 492 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL359198.2-201ENST00000611836 194 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 GABRG2-209ENST00000638660 3799 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 TMEM59-205ENST00000371348 1911 ntTSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 THEMIS-201ENST00000368248 3866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
CCSAPQ6IQ19 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 115.9 ms