Protein–RNA interactions for Protein: Q4LDR2

CTXN3, Cortexin-3, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTXN3Q4LDR2 RNU6-566P-201ENST00000516790 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 EAF1-AS1-207ENST00000599742 772 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL356280.1-201ENST00000603614 379 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 ANP32E-209ENST00000616917 2989 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTND4P23-201ENST00000447723 1363 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNY3P14-201ENST00000384309 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-95P-201ENST00000384697 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC010731.2-201ENST00000415275 440 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 PSPC1-AS2-201ENST00000423023 376 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SPIN4-AS1-201ENST00000451979 426 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC069528.1-201ENST00000490344 705 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC018437.1-201ENST00000492214 406 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 Y_RNA.682-201ENST00000516457 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR3605-201ENST00000583214 100 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 uc_338.15-201ENST00000615470 191 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL449363.1-201ENST00000617815 186 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 CDKN3-212ENST00000620759 196 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 IL6ST-201ENST00000336909 8776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-325P-201ENST00000411132 105 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC093911.1-201ENST00000419129 552 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC01710-201ENST00000446002 390 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SMURF2P1-201ENST00000514992 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC007792.1-201ENST00000623023 402 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 TSLP-202ENST00000379706 2411 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC093274.1-201ENST00000503488 5454 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC006150.1-201ENST00000412014 263 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 PDCL2P1-201ENST00000419302 352 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 MTATP6P23-201ENST00000440153 476 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL138921.2-201ENST00000443919 578 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC023141.11-201ENST00000508864 202 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC025244.2-201ENST00000509215 422 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 SNORA9.3-201ENST00000516383 129 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
CTXN3Q4LDR2 LINC02112-205ENST00000606744 236 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.1 ms