Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL356057.1-201ENST00000533798 831 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC137800.2-201ENST00000574375 120 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC091135.1-201ENST00000585943 307 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR8081-201ENST00000611533 95 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL590808.1-201ENST00000618696 141 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC084768.2-201ENST00000622736 221 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC091931.1-201ENST00000623488 728 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CD44-239ENST00000639002 528 ntTSL 1 (best) BASIC1.33□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 U3.4-201ENST00000363352 213 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-715P-201ENST00000365204 103 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR597-201ENST00000384968 97 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNA5SP212-201ENST00000391223 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RPL7P54-201ENST00000438336 674 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 GTF2IP13-201ENST00000438487 386 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL355997.1-202ENST00000454361 610 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU7-182P-201ENST00000459009 62 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNA5SP269-201ENST00000459032 137 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORD42A-201ENST00000459584 64 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PSMA4-205ENST00000558281 773 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC245748.3-201ENST00000588710 241 ntTSL 3 BASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC245014.2-201ENST00000603689 287 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SEPT7P9-203ENST00000604116 343 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC246785.4-201ENST00000605374 287 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 VBP1-204ENST00000625964 1547 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-1029P-201ENST00000384109 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-248P-201ENST00000410720 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC244636.1-201ENST00000421152 228 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL358934.1-201ENST00000432346 324 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC079448.1-201ENST00000449377 373 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AC009646.1-201ENST00000510455 318 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MTCO3P28-201ENST00000513351 515 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AF117829.1-203ENST00000520306 421 ntTSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AP003086.2-201ENST00000534168 437 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 AL355076.2-202ENST00000553754 574 ntTSL 4 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 LINC01491-201ENST00000558434 505 ntTSL 3 BASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 DEFB122-202ENST00000569013 197 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
SP6Q3SY56 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 143.3 ms