Protein–RNA interactions for Protein: Q16799

RTN1, Reticulon-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTN1Q16799 MIR708-201ENST00000390708 88 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU6-394P-201ENST00000410735 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC078817.1-201ENST00000492623 435 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC107031.1-201ENST00000604939 347 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 THEMIS-205ENST00000626040 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 LINC00648-202ENST00000555985 2885 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 FAM35BP-202ENST00000497389 3337 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 CDH9-201ENST00000231021 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 OTUD6B-AS1-201ENST00000522817 4275 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU6-1081P-201ENST00000384537 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 VDAC1P3-201ENST00000434069 851 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RN7SL323P-201ENST00000494712 295 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 MIR4308-201ENST00000580634 81 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AL451007.1-201ENST00000595491 289 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 VN1R85P-201ENST00000601587 426 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC048347.1-201ENST00000624621 427 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 VGLL4-219ENST00000638314 93 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SLC2A2-201ENST00000314251 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 PCDH15-203ENST00000373955 4230 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 RNU6-1279P-201ENST00000383917 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 U1.1-201ENST00000384101 164 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 AC112220.1-201ENST00000434628 355 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 AP005271.1-201ENST00000582470 412 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 POLK-201ENST00000241436 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 SLC30A6-203ENST00000379343 2354 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
RTN1Q16799 NR3C1-202ENST00000343796 7286 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
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RTN1Q16799 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RNU6-625P-201ENST00000459412 107 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTN1Q16799 LINC00491-204ENST00000513815 582 ntTSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
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RTN1Q16799 AC022695.1-201ENST00000522089 237 ntBASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 ZNF705E-201ENST00000525199 3442 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 SLC6A15-203ENST00000450363 4229 ntTSL 1 (best) BASIC4.46□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 PIGN-210ENST00000588571 1960 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 TMCO5A-203ENST00000558158 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 SNORD50B-201ENST00000364995 70 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 MIR30B-201ENST00000384850 88 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RNA5SP129-201ENST00000410276 118 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RNU6-1135P-201ENST00000411083 103 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 FTH1P6-201ENST00000430768 320 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RAC1P2-201ENST00000511164 579 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RNA5SP208-201ENST00000516156 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 CYCSP30-201ENST00000546447 172 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 MIR3529-201ENST00000637713 78 ntBASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 EVI2B-201ENST00000330927 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
RTN1Q16799 SLC26A7-209ENST00000617078 5094 ntTSL 5 BASIC4.45□□□□□ -1.7
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