Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU6-487P-201ENST00000365430 104 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 S100A12-201ENST00000368737 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SNORA67.3-201ENST00000384366 140 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SNORD70.1-201ENST00000391007 85 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-2P-201ENST00000410396 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNA5SP270-201ENST00000411361 118 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MTCYBP8-201ENST00000422855 651 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC073464.1-201ENST00000429823 534 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 USP9YP14-201ENST00000430663 563 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL445646.1-201ENST00000431784 216 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC079382.1-201ENST00000493346 557 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RPL38P4-201ENST00000502376 214 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SUB1-206ENST00000506237 908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MTCYBP40-201ENST00000509390 1135 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MTCO3P7-201ENST00000510008 774 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-69P-201ENST00000516061 100 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC036222.2-201ENST00000579033 333 ntTSL 3 BASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC007684.1-201ENST00000609671 477 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.15-201ENST00000611544 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.16-201ENST00000613119 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.12-201ENST00000613778 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.20-201ENST00000613956 192 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.9-201ENST00000615427 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.11-201ENST00000616345 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.2-201ENST00000616535 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.3-201ENST00000617785 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.19-201ENST00000618602 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-1-201ENST00000618664 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.6-201ENST00000619225 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.5-201ENST00000619465 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 U2.10-201ENST00000620268 191 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Z69720.2-201ENST00000624755 279 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC005609.4-201ENST00000625071 447 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 HAUS6P2-201ENST00000433254 2404 ntBASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.8□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU6-393P-201ENST00000384475 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-29P-201ENST00000410423 189 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-20P-201ENST00000410425 191 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC092839.1-201ENST00000433475 536 ntTSL 4 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL359636.3-201ENST00000439471 301 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MTATP6P26-201ENST00000445926 662 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LINC00395-202ENST00000451570 415 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC055764.1-201ENST00000454526 473 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.638-201ENST00000459374 113 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LRRC34P2-201ENST00000514850 553 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 HDAC2-AS2-206ENST00000517965 850 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC087463.2-201ENST00000565943 472 ntTSL 3 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MIR3122-201ENST00000577243 73 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MIR5583-1-201ENST00000580941 59 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 NBR2-204ENST00000587322 63 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC096772.1-201ENST00000609146 564 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC022418.1-201ENST00000624118 445 ntBASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC111000.4-202ENST00000505646 2648 ntTSL 2 BASIC1.79□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 Y_RNA.296-201ENST00000364930 108 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 OR9R1P-201ENST00000412200 877 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC064871.1-202ENST00000413954 382 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LINC01650-201ENST00000438093 602 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AL353780.1-201ENST00000455583 458 ntTSL 2 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 LINC02220-201ENST00000510065 270 ntTSL 5 BASIC1.78□□□□□ -2.12
NRF1Q16656 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.78□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.7 ms