Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL353148.1-201ENST00000449761 463 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-120P-201ENST00000516077 103 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-581P-201ENST00000516214 105 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AP002404.1-201ENST00000532005 451 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 CBX3P7-201ENST00000532876 502 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC127024.3-201ENST00000582841 460 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC024153.1-201ENST00000603103 365 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC005046.1-201ENST00000608515 625 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 DCUN1D1-208ENST00000632685 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 KIAA1841-211ENST00000612149 4202 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.2-201ENST00000362330 96 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.128-201ENST00000363391 112 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNORA63-201ENST00000363450 132 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.216-201ENST00000364205 93 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNORA75.6-201ENST00000391318 127 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL513475.1-201ENST00000406602 315 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC023141.4-201ENST00000412031 328 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 USMG5P1-201ENST00000425964 177 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL357873.1-201ENST00000449215 282 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AL354824.2-201ENST00000458004 446 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC008571.1-201ENST00000467232 300 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 S100A11P2-201ENST00000467589 312 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC117440.1-201ENST00000474107 571 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 LINC02110-201ENST00000503870 546 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 RN7SKP272-201ENST00000516988 232 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 ELOCP31-201ENST00000540463 467 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC113146.1-202ENST00000560259 433 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC133104.2-201ENST00000615272 193 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
CNGA3Q16281 TAB3-203ENST00000378930 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DEUP1-202ENST00000525646 1920 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-105P-201ENST00000363909 104 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC062039.1-201ENST00000414394 565 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 LINC01402-201ENST00000422226 279 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 ITCH-AS1-201ENST00000454205 299 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
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CNGA3Q16281 AC097467.3-205ENST00000597955 594 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC097372.5-201ENST00000623665 376 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 EVI2A-201ENST00000247270 1860 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 ADAM3A-203ENST00000461344 2157 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 IL33-203ENST00000456383 2501 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL445259.1-201ENST00000587106 2984 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 TECRL-202ENST00000507440 2876 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 U8.8-201ENST00000365399 135 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 GSTA11P-201ENST00000452866 669 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC074033.2-201ENST00000480669 535 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
CNGA3Q16281 AC108067.1-201ENST00000514304 215 ntTSL 5 BASIC3.01□□□□□ -1.93
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