Protein–RNA interactions for Protein: Q16254

E2F4, Transcription factor E2F4, humanhuman

Predictions only

Length 413 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F4Q16254 STARD4-201ENST00000296632 4606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.23□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MACF1-203ENST00000361689 17538 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 SPART-202ENST00000438666 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNA5SP151-201ENST00000365632 117 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 NFIB-203ENST00000380934 2142 ntTSL 2 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC006369.1-201ENST00000419425 548 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RPL12P3-201ENST00000440080 396 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC117454.1-201ENST00000491120 168 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR4646-201ENST00000580775 63 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR4737-201ENST00000583979 81 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL109935.2-201ENST00000587737 395 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 LINC00901.1-201ENST00000617252 152 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MIR548AY-201ENST00000617669 107 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 VIPR1-AS1-223ENST00000627073 451 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 RIMS2-201ENST00000262231 3854 ntTSL 1 (best) BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 CACNB4-233ENST00000636773 4143 ntTSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 OR56A1-202ENST00000641423 6096 ntAPPRIS P1 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MAP2-202ENST00000360351 9711 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC5.22□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 MPHOSPH9-211ENST00000541076 6136 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PIGN-245ENST00000640252 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.57
E2F4Q16254 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CHRM2-203ENST00000445907 5918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ATP2C1-212ENST00000507488 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SNORA75.5-201ENST00000391291 81 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU6-1064P-201ENST00000410626 104 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNA5SP146-201ENST00000410743 123 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RN7SL329P-201ENST00000467740 299 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 IGLV2-34-201ENST00000490007 283 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MFAP5-211ENST00000540087 492 ntTSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR3667-201ENST00000581025 74 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC140113.4-201ENST00000622087 222 ntBASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CLHC1-201ENST00000401408 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.21□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AMY2A-201ENST00000414303 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SENP7-202ENST00000348610 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SNORD114-7-201ENST00000362520 77 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR586-201ENST00000385035 97 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR105-2-201ENST00000385083 81 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU4-43P-201ENST00000410628 137 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC02534-201ENST00000446525 283 ntTSL 3 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 HSPE1P13-201ENST00000451143 297 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 PDCD5P2-201ENST00000507570 312 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNU7-115P-201ENST00000516433 55 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC044860.2-201ENST00000561005 179 ntBASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SRD5A3-AS1-209ENST00000598819 552 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RANBP6-201ENST00000259569 4576 ntAPPRIS P1 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CENPI-201ENST00000372926 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MAP3K20-202ENST00000375213 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.2□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC015813.1-202ENST00000577267 4056 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CCPG1-202ENST00000425574 1945 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 DENND2C-203ENST00000393277 4730 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SCN1A-218ENST00000640036 8131 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 PIGN-242ENST00000640145 4505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC02327-203ENST00000550122 738 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MIR6853-201ENST00000619642 74 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 WDFY3-201ENST00000295888 14247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LARP4-202ENST00000347328 3621 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 FAM204A-203ENST00000369183 13889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 BMPR2-201ENST00000374574 9683 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 KCNU1-201ENST00000399881 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 TUSC7-203ENST00000477539 2415 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CEP295-201ENST00000325212 8057 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC01505-206ENST00000637046 4266 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 KCNJ16-211ENST00000615244 4190 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 SPZ1-201ENST00000296739 1868 ntAPPRIS P2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 LINC01847-201ENST00000522627 5607 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 MUC12-202ENST00000379442 16737 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 CKAP5-210ENST00000529230 7121 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
E2F4Q16254 RNA5SP87-201ENST00000384155 118 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
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