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| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-5P-201 | ENST00000384238 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-3P-201 | ENST00000384314 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-296P-201 | ENST00000384608 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-2-201 | ENST00000384627 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-9-201 | ENST00000384776 | 107 nt | BASIC | 1.11 | □□□□□ -2.23 | | |
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| ZNHIT3 | Q15649 | AC079943.1-201 | ENST00000491909 | 466 nt | TSL 3 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNA5SP220-201 | ENST00000516298 | 104 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-1003P-201 | ENST00000517099 | 105 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-201P-201 | ENST00000517100 | 61 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC090821.2-201 | ENST00000523552 | 176 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MDM2-232 | ENST00000544561 | 213 nt | TSL 5 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC084364.2-201 | ENST00000546924 | 395 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC090398.1-202 | ENST00000580403 | 457 nt | TSL 2 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR548AC-201 | ENST00000585049 | 88 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC008781.3-201 | ENST00000622826 | 335 nt | TSL 2 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL138955.1-201 | ENST00000622881 | 1040 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC106858.1-201 | ENST00000637497 | 429 nt | BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RBMS2-209 | ENST00000639027 | 192 nt | TSL 5 BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | KIAA1551-201 | ENST00000312561 | 6230 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 1.1 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ICE2P2-201 | ENST00000483823 | 2787 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORD56.1-201 | ENST00000362913 | 68 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-53P-201 | ENST00000365367 | 106 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-360P-201 | ENST00000390944 | 104 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL353777.1-201 | ENST00000425552 | 326 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | TRIM60P10Y-201 | ENST00000425589 | 751 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC106053.1-201 | ENST00000431697 | 368 nt | TSL 3 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC244505.5-201 | ENST00000443639 | 207 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | USP9YP17-201 | ENST00000444617 | 696 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | ANKRD62P1-PARP4P3-201 | ENST00000456726 | 1181 nt | TSL 5 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC096711.1-201 | ENST00000510967 | 347 nt | TSL 5 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SKP1-203 | ENST00000517625 | 876 nt | APPRIS P4 TSL 3 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC145141.2-201 | ENST00000518473 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC139497.1-201 | ENST00000524042 | 501 nt | TSL 5 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | IFNG-AS1-201 | ENST00000536914 | 494 nt | TSL 5 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | NR2F2-AS1-208 | ENST00000560395 | 441 nt | TSL 5 BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | UBE2Q2P8-201 | ENST00000560644 | 102 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC136443.5-201 | ENST00000603741 | 370 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MTND3P19-201 | ENST00000603825 | 345 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC112187.2-201 | ENST00000604345 | 283 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC068205.3-201 | ENST00000636385 | 468 nt | BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.23 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | C9orf84-201 | ENST00000318737 | 4661 nt | APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC | 1.09 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SLC25A46-204 | ENST00000504098 | 2345 nt | TSL 5 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | Y_RNA.255-201 | ENST00000364581 | 97 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORA25.8-201 | ENST00000364831 | 128 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RPS3AP36-201 | ENST00000398190 | 775 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MAGI2-AS2-201 | ENST00000411616 | 476 nt | TSL 2 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC009158.1-206 | ENST00000417476 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | GRM7-AS3-202 | ENST00000417482 | 454 nt | TSL 3 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL591704.2-201 | ENST00000421658 | 181 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MS4A4E-203 | ENST00000425663 | 350 nt | TSL 1 (best) BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | C8orf59P1-201 | ENST00000429930 | 303 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL135790.2-201 | ENST00000437701 | 267 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | DPP10-AS2-201 | ENST00000446992 | 624 nt | TSL 5 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RPL39P29-201 | ENST00000447779 | 157 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | OR2A41P-201 | ENST00000473586 | 105 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | CFLAR-225 | ENST00000494258 | 693 nt | TSL 3 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC079140.2-201 | ENST00000506193 | 142 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORA3.4-201 | ENST00000515969 | 96 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AP003386.1-201 | ENST00000526509 | 504 nt | TSL 3 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC123904.2-201 | ENST00000548059 | 300 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR4307-201 | ENST00000582802 | 84 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL078603.1-201 | ENST00000603824 | 313 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL078604.3-201 | ENST00000615580 | 211 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | MIR8063-201 | ENST00000621930 | 81 nt | BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | PLD1-217 | ENST00000627725 | 174 nt | TSL 5 BASIC | 1.08 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | GNPDA2-204 | ENST00000509756 | 5382 nt | APPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU5E-10P-201 | ENST00000363506 | 118 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | RNU6-384P-201 | ENST00000364900 | 104 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | SNORD114-22-201 | ENST00000365423 | 72 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | CST2P1-201 | ENST00000425770 | 87 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | INTS6L-AS1-201 | ENST00000430820 | 398 nt | TSL 3 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AL589935.1-209 | ENST00000432050 | 418 nt | TSL 5 BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | AC007969.2-201 | ENST00000441891 | 191 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |
| ZNHIT3 | Q15649 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 1.07 | □□□□□ -2.24 | | |