Protein–RNA interactions for Protein: Q15649

ZNHIT3, Zinc finger HIT domain-containing protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNHIT3Q15649 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MTND4P20-201ENST00000424125 869 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL589872.1-201ENST00000426602 288 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL669831.1-202ENST00000428504 417 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPL30P7-201ENST00000479312 323 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RAB11AP2-201ENST00000545905 639 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPL21P5-201ENST00000554662 472 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC012414.6-201ENST00000568241 401 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC108747.1-201ENST00000609508 535 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC091895.1-201ENST00000624494 256 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 SNORD33-201ENST00000362761 85 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 LINC01427-201ENST00000420928 504 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RPS27P16-201ENST00000425758 201 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC027119.1-201ENST00000440877 241 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC093639.1-201ENST00000441026 473 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNA5SP220-201ENST00000516298 104 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-1003P-201ENST00000517099 105 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-201P-201ENST00000517100 61 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MIR548AC-201ENST00000585049 88 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC008781.3-201ENST00000622826 335 ntTSL 2 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL138955.1-201ENST00000622881 1040 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC106858.1-201ENST00000637497 429 ntBASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 KIAA1551-201ENST00000312561 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.1□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 ICE2P2-201ENST00000483823 2787 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 TRIM60P10Y-201ENST00000425589 751 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC106053.1-201ENST00000431697 368 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC244505.5-201ENST00000443639 207 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 USP9YP17-201ENST00000444617 696 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 IFNG-AS1-201ENST00000536914 494 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 NR2F2-AS1-208ENST00000560395 441 ntTSL 5 BASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC136443.5-201ENST00000603741 370 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 MTND3P19-201ENST00000603825 345 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 AC068205.3-201ENST00000636385 468 ntBASIC1.09□□□□□ -2.23
ZNHIT3Q15649 C9orf84-201ENST00000318737 4661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.09□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 Y_RNA.255-201ENST00000364581 97 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 SNORA25.8-201ENST00000364831 128 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 RPS3AP36-201ENST00000398190 775 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 MAGI2-AS2-201ENST00000411616 476 ntTSL 2 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AC009158.1-206ENST00000417476 454 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 GRM7-AS3-202ENST00000417482 454 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AL591704.2-201ENST00000421658 181 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 C8orf59P1-201ENST00000429930 303 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 OR2A41P-201ENST00000473586 105 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 CFLAR-225ENST00000494258 693 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AC079140.2-201ENST00000506193 142 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 SNORA3.4-201ENST00000515969 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AP003386.1-201ENST00000526509 504 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AC123904.2-201ENST00000548059 300 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 MIR4307-201ENST00000582802 84 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AL078603.1-201ENST00000603824 313 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AL078604.3-201ENST00000615580 211 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 MIR8063-201ENST00000621930 81 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.08□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 RNU5E-10P-201ENST00000363506 118 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 SNORD114-22-201ENST00000365423 72 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 CST2P1-201ENST00000425770 87 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AL589935.1-209ENST00000432050 418 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
ZNHIT3Q15649 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119 ms