Protein–RNA interactions for Protein: Q15517

CDSN, Corneodesmosin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDSNQ15517 CSPP1-203ENST00000519668 3715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 INPP4B-215ENST00000509777 4334 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PTPN22-202ENST00000420377 2726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC100821.1-201ENST00000523153 2479 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL359693.1-201ENST00000614959 2407 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 LRRTM4-201ENST00000409088 3616 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 DDR2-202ENST00000367922 10160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 KIF2A-205ENST00000506857 2219 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 OR8D1-203ENST00000641897 8285 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SMC1B-201ENST00000357450 4201 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 CNTRL-201ENST00000238341 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 Y_RNA.7-201ENST00000362352 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNA5SP235-201ENST00000365411 114 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-741P-201ENST00000383889 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-211P-201ENST00000384047 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR128-1-201ENST00000384921 82 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR329-1-201ENST00000385028 80 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL035461.1-201ENST00000421490 332 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC098614.2-201ENST00000426040 255 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL451129.1-201ENST00000437471 285 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC005042.3-201ENST00000453230 174 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC132825.2-201ENST00000483901 504 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RN7SL271P-201ENST00000487601 295 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 HMGB1P22-201ENST00000505315 124 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 BTF3L4P4-201ENST00000506381 449 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC010451.3-201ENST00000511721 444 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU2-58P-201ENST00000516403 183 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-1256P-201ENST00000516539 103 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-919P-201ENST00000516731 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC016885.2-201ENST00000522598 261 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL391261.3-201ENST00000557194 520 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR3921-201ENST00000577308 85 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SNORA62.6-201ENST00000606322 83 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RMDN2-AS1-204ENST00000626669 448 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 CNOT2-231ENST00000551483 4753 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PCDH9-201ENST00000377861 28227 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 DCX-202ENST00000358070 9405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PLCE1-202ENST00000371380 12024 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 BCAP29-203ENST00000379119 5773 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MCF2-202ENST00000370573 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 ROBO2-213ENST00000614793 7662 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 EFR3A-208ENST00000637848 2547 ntTSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 PLCB4-204ENST00000378501 5833 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 CSNK1G3-203ENST00000361991 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 Y_RNA.75-201ENST00000362927 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 Y_RNA.121-201ENST00000363309 113 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 Y_RNA.238-201ENST00000364441 102 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RNU6-44P-201ENST00000384045 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC004870.4-201ENST00000424359 360 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AL356867.1-201ENST00000429623 299 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC135371.1-201ENST00000446964 453 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RPS27AP9-201ENST00000477681 438 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 RPS4XP22-201ENST00000480755 780 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MLLT10P2-201ENST00000506434 249 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 AC215217.1-201ENST00000562162 347 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
CDSNQ15517 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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