Protein–RNA interactions for Protein: Q15361

TTF1, Transcription termination factor 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 905 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTF1Q15361 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 Y_RNA.604-201ENST00000410574 102 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 BX276092.3-201ENST00000424182 230 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 RN7SKP24-201ENST00000515888 284 ntBASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 CREBRF-201ENST00000296953 7778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.41□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 MTND5P19-201ENST00000424872 1794 ntBASIC3.4□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 LEPR-202ENST00000349533 8227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.86
TTF1Q15361 Y_RNA.151-201ENST00000363566 112 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-692P-201ENST00000384496 107 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR634-201ENST00000385208 97 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RN7SKP158-201ENST00000410453 326 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC00459-201ENST00000431656 376 ntTSL 2 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC009969.1-201ENST00000438726 172 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AP001486.1-201ENST00000463339 476 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL049873.1-201ENST00000480540 376 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RN7SL283P-201ENST00000489055 303 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC105029.1-201ENST00000520250 669 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AP001189.6-201ENST00000528781 831 ntTSL 1 (best) BASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC027176.1-201ENST00000560204 514 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR6128-201ENST00000615528 109 ntBASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.4□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ZNF676-201ENST00000397121 2944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU5E-4P-201ENST00000364931 120 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR521-1-201ENST00000384902 87 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MT-TD-201ENST00000387419 68 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL451074.5-201ENST00000415894 435 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 NUP35P1-201ENST00000422734 947 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL390067.1-201ENST00000440009 420 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AP004217.1-201ENST00000480579 346 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-507P-201ENST00000516045 100 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.804-201ENST00000615262 101 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC092593.1-201ENST00000515413 1815 ntBASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 ZMYM1-201ENST00000359858 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.39□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC008264.2-201ENST00000610193 3731 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 NETO1-202ENST00000397929 1849 ntTSL 1 (best) BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR26A1-201ENST00000362205 77 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AP000560.1-201ENST00000624150 1937 ntBASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 FOXP2-210ENST00000403559 6415 ntTSL 2 BASIC3.38□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 Y_RNA.482-201ENST00000384377 111 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR627-201ENST00000384979 97 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC022028.1-201ENST00000412054 408 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC091153.2-202ENST00000441700 384 ntTSL 3 BASIC3.37□□□□□ -1.87
TTF1Q15361 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC3.37□□□□□ -1.87
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