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| TTF1 | Q15361 | TRAV34-201 | ENST00000390461 | 349 nt | APPRIS P1 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| TTF1 | Q15361 | Y_RNA.604-201 | ENST00000410574 | 102 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| TTF1 | Q15361 | BX276092.3-201 | ENST00000424182 | 230 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| TTF1 | Q15361 | SIRPG-AS1-201 | ENST00000437384 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL136987.2-201 | ENST00000457321 | 684 nt | TSL 3 BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
| TTF1 | Q15361 | RPL30P12-201 | ENST00000474666 | 353 nt | BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| TTF1 | Q15361 | CREBRF-201 | ENST00000296953 | 7778 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.41 | □□□□□ -1.86 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AP001189.6-201 | ENST00000528781 | 831 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC027176.1-201 | ENST00000560204 | 514 nt | BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | NBPF20-202 | ENST00000392971 | 18450 nt | APPRIS P2 TSL 5 BASIC | 3.4 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | LTN1-201 | ENST00000361371 | 7685 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | ZNF676-201 | ENST00000397121 | 2944 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AC083867.1-201 | ENST00000413567 | 457 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AL390067.1-201 | ENST00000440009 | 420 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AL136164.1-201 | ENST00000456795 | 352 nt | TSL 3 BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | SEMG1-201 | ENST00000372781 | 1662 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 3.39 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | CFHR4-202 | ENST00000367416 | 2178 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC008264.2-201 | ENST00000610193 | 3731 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | NETO1-202 | ENST00000397929 | 1849 nt | TSL 1 (best) BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | MIR26A1-201 | ENST00000362205 | 77 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AC124290.1-202 | ENST00000523342 | 387 nt | TSL 3 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC078795.3-201 | ENST00000602913 | 472 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AP000560.1-201 | ENST00000624150 | 1937 nt | BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | FOXP2-210 | ENST00000403559 | 6415 nt | TSL 2 BASIC | 3.38 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | RRAS2-211 | ENST00000537760 | 2034 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC080128.1-201 | ENST00000474389 | 1917 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | NOX4-202 | ENST00000343727 | 3347 nt | TSL 2 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | AL139281.1-201 | ENST00000422120 | 335 nt | BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
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| TTF1 | Q15361 | LINC02336-201 | ENST00000434117 | 330 nt | TSL 3 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC091153.2-202 | ENST00000441700 | 384 nt | TSL 3 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |
| TTF1 | Q15361 | AC117462.1-201 | ENST00000461186 | 554 nt | TSL 4 BASIC | 3.37 | □□□□□ -1.87 | | |