Protein–RNA interactions for Protein: Q14524

SCN5A, Sodium channel protein type 5 subunit alpha, humanhuman

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Length 2,016 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN5AQ14524 RMDN2-205ENST00000407257 2280 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PALMD-205ENST00000615664 1844 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 Y_RNA.144-201ENST00000363521 113 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL353621.1-201ENST00000418219 243 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL445465.2-201ENST00000455530 461 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC096745.1-201ENST00000509945 370 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-914P-201ENST00000516749 109 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL117187.1-201ENST00000555482 181 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC092718.6-202ENST00000563072 408 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SUB1P3-201ENST00000564581 315 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC009229.3-201ENST00000608056 282 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC091925.1-201ENST00000623204 462 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL512643.1-201ENST00000635735 524 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL158064.1-201ENST00000627044 2242 ntTSL 4 BASIC2.76□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNX10-209ENST00000619420 2361 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 ARID2-206ENST00000457135 4356 ntTSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNORA23-201ENST00000365128 182 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-395P-201ENST00000365662 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL359511.1-201ENST00000402970 211 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL135786.1-201ENST00000415892 214 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 HMGB1P30-201ENST00000492455 606 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC006445.2-201ENST00000510061 472 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL359273.1-201ENST00000510918 627 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-911P-201ENST00000516523 104 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-307P-201ENST00000516743 106 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 G2E3-AS1-202ENST00000550118 609 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR3149-201ENST00000584629 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SYT14-204ENST00000472886 2966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC138393.1-203ENST00000327086 343 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNORA41-201ENST00000384675 132 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-607P-201ENST00000411283 108 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC073311.1-201ENST00000420146 505 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL592045.1-201ENST00000429867 352 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 CEACAMP4-201ENST00000457676 421 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC022493.1-201ENST00000492984 337 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC113155.1-201ENST00000511141 769 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 C4orf22-209ENST00000621014 228 ntTSL 3 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 CHD9-203ENST00000447540 11509 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 NEB-204ENST00000409198 20637 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AF165147.1-201ENST00000433310 6103 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AF127577.6-201ENST00000623352 2191 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 PSG1-205ENST00000595124 1692 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC002546.1-201ENST00000588041 2504 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU5A-1-201ENST00000362698 116 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 EI24P1-201ENST00000416584 867 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL096701.2-201ENST00000416920 238 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC079780.1-201ENST00000428259 207 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC010265.1-201ENST00000513509 211 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC009902.1-201ENST00000519351 183 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 MAL2-206ENST00000522187 547 ntTSL 4 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 OR5D17P-201ENST00000531492 978 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC087463.1-201ENST00000568541 556 ntTSL 2 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 AL162373.1-201ENST00000620433 407 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 SENP7-206ENST00000394094 4703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 CCDC30-212ENST00000507855 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 DEFB108F-201ENST00000344638 222 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
SCN5AQ14524 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
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