Protein–RNA interactions for Protein: Q14050

COL9A3, Collagen alpha-3(IX) chain, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL9A3Q14050 ZBED5-201ENST00000413761 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC018529.3-201ENST00000624212 2254 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 IL1RL1-204ENST00000409584 2693 ntTSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 FIGNL1-201ENST00000356889 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC018462.1-201ENST00000425966 1684 ntTSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1272P-201ENST00000362776 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-199P-201ENST00000362954 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-166P-201ENST00000384371 107 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR514A1-201ENST00000385133 98 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 HLFP1-201ENST00000402375 499 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 BTF3P11-201ENST00000426582 477 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RPL23AP58-201ENST00000440453 469 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC092798.1-201ENST00000458542 409 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RPS20P22-201ENST00000473700 357 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC107027.2-201ENST00000512197 115 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC022784.7-201ENST00000520017 651 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL121603.1-201ENST00000553815 142 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC004825.2-201ENST00000616634 455 ntBASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SERPINI2-207ENST00000476257 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CNOT10-206ENST00000454516 2760 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MME-201ENST00000360490 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.43□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 NBPF10-201ENST00000583866 13042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SEMA3D-201ENST00000284136 6265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 DOCK7-211ENST00000634264 6303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SKIL-201ENST00000259119 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-899P-201ENST00000363947 107 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-173P-201ENST00000364215 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1074P-201ENST00000383995 104 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU1-89P-201ENST00000384592 164 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TNFRSF17-202ENST00000396495 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RN7SL93P-201ENST00000463035 293 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC110768.1-201ENST00000509222 400 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC01969-201ENST00000514468 455 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-572P-201ENST00000516724 80 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNA5SP290-201ENST00000517133 127 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC104393.1-201ENST00000517495 255 ntTSL 3 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL355376.2-201ENST00000603866 267 ntTSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MIR486-1-201ENST00000612171 68 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL121772.2-201ENST00000614331 297 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL353748.2-201ENST00000622148 471 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC241585.2-209ENST00000638217 143 ntBASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SLC38A2-209ENST00000551374 2802 ntTSL 2 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC01091-203ENST00000514823 5262 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 THOC1-219ENST00000616322 2078 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SCAI-201ENST00000336505 12079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.42□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SKP1-209ENST00000522552 1683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 GDAP2-202ENST00000369443 8828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC079160.1-202ENST00000508406 2795 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RNU6-178P-201ENST00000384631 104 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL031386.1-201ENST00000411940 142 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AL133547.1-201ENST00000448546 220 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 snoU109.2-201ENST00000459316 135 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC139453.3-201ENST00000493276 369 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC093893.1-201ENST00000505781 510 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CYCSP23-201ENST00000519781 313 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 UBE2Q2P8-201ENST00000560644 102 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TEX41-300ENST00000631048 69 ntTSL 5 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 TAX1BP1-213ENST00000543117 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 AKAP11-201ENST00000025301 9920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 P2RY13-201ENST00000325602 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.41□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 FAM169A-201ENST00000389156 5990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 FLJ46284-201ENST00000504861 3421 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 POU2F1-206ENST00000429375 13651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 DLX6-AS1-201ENST00000430027 15364 ntTSL 2 BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 CSMD3-204ENST00000455883 12485 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 HTR2B-201ENST00000258400 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
COL9A3Q14050 RAD17-206ENST00000358030 2648 ntTSL 1 (best) BASIC4.4□□□□□ -1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms